26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8589 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  723    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3138  hypothetical protein  58 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.368738  normal  0.136262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0950  hypothetical protein  44.86 
 
 		 530 aa  262  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.184254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5243  hypothetical protein  31.6 
 
 		 353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  28.61 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  25.08 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  31.5 
 
 		 620 aa  76.3  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  26.09 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  25 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  28.8 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  25 
 
 		 900 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  30.56 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  30.56 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  27.97 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  27.85 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  27.46 
 
 		 520 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 1231 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  26.75 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  28.97 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  28.65 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  29.15 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  27.09 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  26.7 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  26.15 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  26.69 
 
 		 285 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  26.69 
 
 		 300 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>