20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3138 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3138  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  683    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.368738  normal  0.136262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  58 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0950  hypothetical protein  42.17 
 
 		 530 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.184254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  28.77 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5243  hypothetical protein  29.41 
 
 		 353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  25.16 
 
 		 374 aa  86.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  31.49 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  28.95 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  25.71 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  30.6 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  24.4 
 
 		 900 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 		 1231 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  27.44 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  24.71 
 
 		 415 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  21.41 
 
 		 519 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  25.1 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  26.48 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  26.9 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  26.48 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>