71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3259 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 330 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  37.72 
 
 		 415 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  36.57 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  32.06 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  35.29 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  35.29 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  35.29 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  36.05 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  33.33 
 
 		 519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  34.33 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  32.56 
 
 		 520 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  31.9 
 
 		 900 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  40.88 
 
 		 490 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  31.47 
 
 		 519 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  30.52 
 
 		 558 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  27.2 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 		 1231 aa  85.9  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  26.39 
 
 		 533 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  30.05 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  28 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  31.41 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  31.03 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  31.03 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  29.5 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  25.97 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  31.46 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  28.92 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  30.94 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  30.04 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  28.86 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  29.41 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  29.57 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  29.21 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  28.26 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  26.34 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  29.89 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.56 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.9 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  30.97 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  30.38 
 
 		 711 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  30.77 
 
 		 496 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.25 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  25.25 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.43 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  28.5 
 
 		 880 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  26.98 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28 
 
 		 644 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  31.43 
 
 		 649 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.52 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  29.71 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.58 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  30.43 
 
 		 426 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  38.32 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  24.37 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  31.43 
 
 		 524 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.16 
 
 		 532 aa  49.3  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  27.56 
 
 		 652 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28 
 
 		 886 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  30.77 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  31.48 
 
 		 443 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.4 
 
 		 584 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.83 
 
 		 701 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  35.29 
 
 		 815 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  30.34 
 
 		 577 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  31.18 
 
 		 591 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3138  hypothetical protein  27.39 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.368738  normal  0.136262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.97 
 
 		 558 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  34.17 
 
 		 506 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  25.98 
 
 		 580 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.78 
 
 		 469 aa  42.7  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>