44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4953 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 376 aa  771    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  44.99 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  40.39 
 
 		 364 aa  282  7.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.7 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  41.09 
 
 		 383 aa  262  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.17 
 
 		 409 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  29.3 
 
 		 583 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 		 591 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  30.86 
 
 		 590 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.1 
 
 		 857 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  29.53 
 
 		 577 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.03 
 
 		 532 aa  89.7  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  22.73 
 
 		 458 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.78 
 
 		 584 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  27.76 
 
 		 315 aa  86.3  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.54 
 
 		 506 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.61 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  28.93 
 
 		 711 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.57 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  28.43 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.5 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  33.16 
 
 		 694 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.14 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.23 
 
 		 701 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  30.3 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 506 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  25.89 
 
 		 815 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  28.93 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  26.67 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  26.67 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 728 aa  59.7  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  26.67 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  24.37 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  30.23 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  31.18 
 
 		 900 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  30.49 
 
 		 407 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  30.12 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  35.62 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  27.71 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  25.44 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  23.9 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  24.19 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  25.62 
 
 		 519 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  27.66 
 
 		 533 aa  43.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>