38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5393 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  100 
 
 		 342 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.64 
 
 		 506 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 		 591 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  32.34 
 
 		 577 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  32.1 
 
 		 728 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.4 
 
 		 469 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.96 
 
 		 532 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.36 
 
 		 506 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.57 
 
 		 701 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.69 
 
 		 558 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  30.45 
 
 		 694 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.71 
 
 		 584 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 		 506 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.7 
 
 		 417 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  26.63 
 
 		 583 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  25.56 
 
 		 711 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  31.07 
 
 		 815 aa  93.6  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 590 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  24.92 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  26.59 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.54 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.65 
 
 		 857 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.71 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  28.72 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  23.05 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  23.15 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  22.04 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  29.37 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  31.29 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  24.29 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  24.29 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  22.52 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  33.33 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  27.7 
 
 		 519 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  32.35 
 
 		 415 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  23.73 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>