45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3531 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  100 
 
 		 313 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  29.41 
 
 		 711 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.44 
 
 		 506 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 728 aa  92.4  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.55 
 
 		 506 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.84 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.35 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.53 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.57 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.5 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 		 591 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.74 
 
 		 558 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.45 
 
 		 701 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  28.87 
 
 		 577 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.13 
 
 		 584 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  28.72 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.56 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.42 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  30.67 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  27.04 
 
 		 583 aa  59.3  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  26.7 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  28.06 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.23 
 
 		 857 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  35 
 
 		 409 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  28.44 
 
 		 355 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  29.71 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  35.48 
 
 		 490 aa  49.7  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  35.34 
 
 		 285 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  35.34 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  35.37 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  35.8 
 
 		 442 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  37.04 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  35.34 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  27.64 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  27.64 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  29.84 
 
 		 519 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  29.95 
 
 		 348 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  33.33 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  31.58 
 
 		 367 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  32.06 
 
 		 426 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>