41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0467 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 380 aa  773    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  44.47 
 
 		 376 aa  345  5e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  42.71 
 
 		 385 aa  301  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  42.22 
 
 		 364 aa  289  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  40.34 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.04 
 
 		 409 aa  209  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 		 591 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  25.34 
 
 		 577 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.39 
 
 		 506 aa  99.8  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  26.27 
 
 		 590 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.47 
 
 		 558 aa  93.2  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.79 
 
 		 469 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.08 
 
 		 584 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  24.76 
 
 		 583 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.42 
 
 		 701 aa  79.7  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  24.63 
 
 		 711 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.2 
 
 		 857 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  27.27 
 
 		 815 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.25 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  23.93 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  33.5 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.75 
 
 		 532 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.74 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 728 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  29.18 
 
 		 694 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  26.98 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  39.76 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  39.76 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  39.76 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 		 330 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  26.19 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  30.77 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  24.67 
 
 		 901 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  32.53 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  33.72 
 
 		 900 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  28.91 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  21.61 
 
 		 519 aa  43.1  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  28.09 
 
 		 409 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>