52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2752 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  100 
 
 		 620 aa  1195    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  29.58 
 
 		 900 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  31.65 
 
 		 366 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  30.38 
 
 		 314 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  31.2 
 
 		 335 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  26.4 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  31.86 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  31.86 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  32.19 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  33.33 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3138  hypothetical protein  29.2 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.368738  normal  0.136262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  30.03 
 
 		 330 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  31.71 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  30.08 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  28.37 
 
 		 407 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  31.63 
 
 		 490 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  27.27 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  25.93 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  27.71 
 
 		 334 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  26.71 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  27.62 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  26.88 
 
 		 322 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  21.86 
 
 		 1231 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0950  hypothetical protein  26.52 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.184254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  26.48 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  28.69 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  21.79 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1017  hypothetical protein  26.62 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  33.82 
 
 		 780 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  27 
 
 		 314 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  32.04 
 
 		 429 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  25.54 
 
 		 519 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5243  hypothetical protein  26.37 
 
 		 353 aa  54.3  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  29.25 
 
 		 880 aa  53.9  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  29.65 
 
 		 358 aa  53.5  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  26.98 
 
 		 321 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  25.77 
 
 		 520 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  22.75 
 
 		 345 aa  51.6  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1428  hypothetical protein  37.76 
 
 		 794 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  25.29 
 
 		 314 aa  50.4  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  27.13 
 
 		 348 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  29.7 
 
 		 360 aa  49.3  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.87 
 
 		 886 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  25.68 
 
 		 314 aa  48.9  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  24.87 
 
 		 558 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1660  hypothetical protein  33.69 
 
 		 336 aa  47.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  27.03 
 
 		 302 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  22.04 
 
 		 367 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  27.03 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  34.69 
 
 		 623 aa  46.6  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  26.92 
 
 		 652 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.54 
 
 		 639 aa  45.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>