31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3043 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  100 
 
 		 558 aa  1157    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  29.51 
 
 		 880 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  28.84 
 
 		 307 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.57 
 
 		 886 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  26.45 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  26.55 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  26.64 
 
 		 314 aa  117  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  27.5 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  29.18 
 
 		 322 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  25.87 
 
 		 314 aa  113  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  28.85 
 
 		 322 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  25.1 
 
 		 321 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  24.72 
 
 		 325 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  30.52 
 
 		 330 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  27.52 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 		 1231 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  27.75 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  27.78 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  25.43 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  24.73 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  25.94 
 
 		 285 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  25.94 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  24.86 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  25.11 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  27.86 
 
 		 334 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  24.14 
 
 		 519 aa  54.7  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  23.81 
 
 		 351 aa  50.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  24.48 
 
 		 620 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  26.79 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  23 
 
 		 900 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  25 
 
 		 375 aa  43.5  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>