24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3671 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  100 
 
 
613 aa  1234    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  58.24 
 
 
605 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  39.67 
 
 
427 aa  270  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  45.27 
 
 
580 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  44.52 
 
 
376 aa  260  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  42.57 
 
 
417 aa  260  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  45.36 
 
 
351 aa  257  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  42.03 
 
 
901 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  40.63 
 
 
533 aa  249  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  42.31 
 
 
443 aa  237  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  45.1 
 
 
496 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  39.01 
 
 
649 aa  204  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  32.34 
 
 
380 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  29.79 
 
 
429 aa  94.4  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  32.42 
 
 
490 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  24 
 
 
524 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  24.62 
 
 
680 aa  60.5  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  32.98 
 
 
367 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  32.98 
 
 
351 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  30.23 
 
 
360 aa  48.5  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  27.34 
 
 
348 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48536  predicted protein  26.35 
 
 
486 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0226991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  28.24 
 
 
900 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  23.76 
 
 
409 aa  43.9  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>