25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3201 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  42.91 
 
 		 524 aa  212  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  38.66 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  27.8 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  27.34 
 
 		 680 aa  79.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  28.42 
 
 		 649 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  29.73 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  27.9 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  26.35 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  26.48 
 
 		 427 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  27.2 
 
 		 580 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  27.12 
 
 		 901 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  25.2 
 
 		 605 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  26.9 
 
 		 417 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  37.39 
 
 		 407 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  34.96 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  26.42 
 
 		 533 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  29.09 
 
 		 380 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  24.83 
 
 		 613 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  29.38 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  33.05 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  35.51 
 
 		 442 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  33.05 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  28.57 
 
 		 900 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  30.17 
 
 		 334 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>