16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4623 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  100 
 
 		 680 aa  1365    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  37.46 
 
 		 524 aa  185  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  27 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  27.11 
 
 		 533 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  27.34 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  27.07 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  25.39 
 
 		 351 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  26.45 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  28.32 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  25.87 
 
 		 417 aa  67  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  28.12 
 
 		 605 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  27.33 
 
 		 649 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  24.66 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  23.29 
 
 		 580 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  24.19 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  23.36 
 
 		 901 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>