83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2612 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  93.47 
 
 
505 aa  949    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 
505 aa  1032    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  44.51 
 
 
346 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  43.65 
 
 
1302 aa  258  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  38.77 
 
 
755 aa  243  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  38.15 
 
 
930 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  39.74 
 
 
426 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  42.01 
 
 
630 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  39.32 
 
 
322 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  38.62 
 
 
638 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  35.15 
 
 
748 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  38.22 
 
 
347 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  39.02 
 
 
709 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  37.7 
 
 
459 aa  209  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  36.89 
 
 
466 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  36.01 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  37.8 
 
 
610 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  37.13 
 
 
426 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  37.03 
 
 
1167 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  33.96 
 
 
457 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  26.35 
 
 
1294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  43.42 
 
 
1209 aa  124  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  44.9 
 
 
1121 aa  124  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  43.05 
 
 
656 aa  124  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  43.05 
 
 
678 aa  123  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.66 
 
 
887 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  42.76 
 
 
763 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  43.05 
 
 
1298 aa  121  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  42.11 
 
 
1137 aa  121  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  39.07 
 
 
1478 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  39.07 
 
 
1369 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  39.07 
 
 
1414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.48 
 
 
938 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  39.07 
 
 
1904 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  38.41 
 
 
1759 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  38.82 
 
 
467 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.41 
 
 
833 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.5 
 
 
857 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  33.9 
 
 
522 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.53 
 
 
985 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.67 
 
 
919 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  38.16 
 
 
1017 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  34.46 
 
 
949 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 
928 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.96 
 
 
1853 aa  97.8  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  36.3 
 
 
473 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  34.9 
 
 
308 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  33.79 
 
 
658 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  35.62 
 
 
2344 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  36.54 
 
 
1050 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  33.53 
 
 
961 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  37.97 
 
 
619 aa  89.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  30.24 
 
 
717 aa  87  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  23.81 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  30.73 
 
 
486 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  33.33 
 
 
1546 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  25.66 
 
 
651 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  30.82 
 
 
1224 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  29.85 
 
 
1221 aa  72.8  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 
660 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  23.98 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  24.4 
 
 
626 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  33.33 
 
 
671 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  23.92 
 
 
1194 aa  68.2  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  28.64 
 
 
703 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  22.73 
 
 
365 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  29.56 
 
 
1013 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 
728 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  26.58 
 
 
332 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  21.67 
 
 
1004 aa  57  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  31.21 
 
 
481 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  26.09 
 
 
584 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  23.47 
 
 
445 aa  53.9  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 
335 aa  53.9  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  23.47 
 
 
340 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  26.81 
 
 
335 aa  53.5  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  23.44 
 
 
768 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  24.36 
 
 
478 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  21.61 
 
 
468 aa  47.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  25.37 
 
 
900 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  24.43 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>