211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0460 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  52.77 
 
 		 880 aa  736    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  57.64 
 
 		 1137 aa  712    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  54.19 
 
 		 990 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 		 1017 aa  2057    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  52.82 
 
 		 847 aa  725    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  49.85 
 
 		 846 aa  630  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.08 
 
 		 985 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  48.67 
 
 		 794 aa  586  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.58 
 
 		 887 aa  537  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  43.88 
 
 		 1759 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  44.1 
 
 		 739 aa  515  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  41.68 
 
 		 710 aa  482  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  43.32 
 
 		 725 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  42.07 
 
 		 737 aa  463  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  40.33 
 
 		 730 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  39.68 
 
 		 736 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  40 
 
 		 1369 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  36.19 
 
 		 715 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  35.89 
 
 		 742 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  40.04 
 
 		 563 aa  319  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  32.5 
 
 		 707 aa  309  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  36.71 
 
 		 526 aa  304  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  30.75 
 
 		 984 aa  293  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  30.96 
 
 		 757 aa  287  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  31.8 
 
 		 686 aa  274  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  29.82 
 
 		 928 aa  270  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 894 aa  270  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 		 961 aa  267  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  28.4 
 
 		 949 aa  260  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  33.05 
 
 		 854 aa  243  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 		 789 aa  240  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  31.5 
 
 		 611 aa  222  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  28.72 
 
 		 778 aa  217  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  33.68 
 
 		 590 aa  193  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  28.86 
 
 		 2042 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  53.69 
 
 		 678 aa  146  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  53.69 
 
 		 1298 aa  146  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  53.69 
 
 		 656 aa  145  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  50.99 
 
 		 1121 aa  144  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  52.35 
 
 		 1209 aa  144  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  53.02 
 
 		 763 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  46.64 
 
 		 1007 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  44.67 
 
 		 1478 aa  135  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  44.67 
 
 		 1294 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.03 
 
 		 833 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  44 
 
 		 1904 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  44.67 
 
 		 1414 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  42.05 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  26.12 
 
 		 978 aa  124  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  44.39 
 
 		 762 aa  118  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  33.54 
 
 		 658 aa  116  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.55 
 
 		 919 aa  109  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  45.11 
 
 		 473 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.35 
 
 		 938 aa  105  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  37.5 
 
 		 505 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  38.16 
 
 		 505 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  35.84 
 
 		 2344 aa  99.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  34.18 
 
 		 308 aa  99.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  37.06 
 
 		 1853 aa  99  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  39.87 
 
 		 619 aa  97.8  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  36.79 
 
 		 1887 aa  97.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.54 
 
 		 857 aa  95.9  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  34.78 
 
 		 522 aa  95.1  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.48 
 
 		 729 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 1224 aa  89.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  63.95 
 
 		 727 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  38.31 
 
 		 1160 aa  89  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  31.9 
 
 		 671 aa  88.6  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 		 660 aa  84.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  37.37 
 
 		 1004 aa  84.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  49.64 
 
 		 978 aa  84.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  46.02 
 
 		 938 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  39.8 
 
 		 854 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  39.89 
 
 		 1050 aa  82  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  49.28 
 
 		 543 aa  82  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  33.33 
 
 		 1050 aa  82  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  39.81 
 
 		 768 aa  81.6  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  53.57 
 
 		 523 aa  81.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  36.98 
 
 		 2170 aa  81.6  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  57.28 
 
 		 681 aa  81.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.5 
 
 		 809 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  40 
 
 		 743 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  43.39 
 
 		 973 aa  79.7  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  29.09 
 
 		 1013 aa  79.3  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  36.04 
 
 		 1221 aa  78.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  34.16 
 
 		 598 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  36.27 
 
 		 2286 aa  77  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  53.61 
 
 		 543 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  31.96 
 
 		 465 aa  73.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.66 
 
 		 6885 aa  73.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  33.95 
 
 		 1546 aa  71.6  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  37.63 
 
 		 445 aa  70.5  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  33.16 
 
 		 803 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  40.91 
 
 		 651 aa  69.7  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  28.24 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.62 
 
 		 998 aa  67  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  42.72 
 
 		 699 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  53.75 
 
 		 544 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  46.53 
 
 		 617 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>