46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9095 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  951    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  43.07 
 
 
473 aa  345  8.999999999999999e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2754  hydrolase (secreted protein)  64.02 
 
 
306 aa  339  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4761  hypothetical protein  53.71 
 
 
311 aa  285  9e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202434  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2660  hydrolase (secreted protein)  49.25 
 
 
317 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0283317  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3159  hydrolase (secreted protein)  43.73 
 
 
322 aa  246  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.090104  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  41.76 
 
 
1121 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  45.21 
 
 
1209 aa  146  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  43.15 
 
 
678 aa  140  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  43.15 
 
 
656 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  43.15 
 
 
1137 aa  139  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  42.47 
 
 
1298 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  43.15 
 
 
763 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  45.03 
 
 
1017 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.89 
 
 
887 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  37.5 
 
 
1414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  37.5 
 
 
1294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  37.5 
 
 
1369 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  37.5 
 
 
1478 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  38.82 
 
 
505 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  37.5 
 
 
1759 aa  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  36.84 
 
 
1904 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.33 
 
 
833 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.09 
 
 
985 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.61 
 
 
919 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  37.28 
 
 
1853 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  36.67 
 
 
505 aa  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.1 
 
 
857 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36 
 
 
938 aa  100  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  32.04 
 
 
1546 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  32.03 
 
 
522 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  38.61 
 
 
619 aa  93.6  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  33.55 
 
 
486 aa  87.8  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 
928 aa  87.8  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  30 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  30.57 
 
 
949 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  26.7 
 
 
1050 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  31.01 
 
 
658 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 
1224 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  29.49 
 
 
961 aa  77  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  29.81 
 
 
671 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  32.61 
 
 
728 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
660 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  24.73 
 
 
1013 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  27.67 
 
 
2344 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  29.35 
 
 
268 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>