100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3367 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  62.27 
 
 		 739 aa  837    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  60.45 
 
 		 736 aa  831    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  57.21 
 
 		 1369 aa  743    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  52.06 
 
 		 846 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  66.2 
 
 		 1759 aa  899    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.1 
 
 		 887 aa  855    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  63.54 
 
 		 725 aa  846    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 		 985 aa  2004    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  61.98 
 
 		 730 aa  847    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  45.66 
 
 		 710 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  51.53 
 
 		 880 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  43.84 
 
 		 847 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  44.71 
 
 		 794 aa  595  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  36.94 
 
 		 1017 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  47.99 
 
 		 990 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  46.45 
 
 		 1137 aa  543  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 		 742 aa  519  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  43.41 
 
 		 715 aa  516  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  39.29 
 
 		 737 aa  443  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  39.85 
 
 		 707 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  37.96 
 
 		 686 aa  389  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  41.37 
 
 		 563 aa  351  4e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  33.87 
 
 		 757 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  40.04 
 
 		 526 aa  348  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  46.81 
 
 		 857 aa  331  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  32.34 
 
 		 984 aa  323  8e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  33.24 
 
 		 928 aa  319  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 		 961 aa  312  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  30.88 
 
 		 949 aa  304  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  32.1 
 
 		 854 aa  291  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.2 
 
 		 919 aa  280  8e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 		 894 aa  280  8e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  30.21 
 
 		 789 aa  280  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  30.61 
 
 		 778 aa  263  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  33.21 
 
 		 611 aa  258  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  30.9 
 
 		 978 aa  183  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  30.54 
 
 		 2042 aa  183  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  58.67 
 
 		 938 aa  180  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  52.5 
 
 		 1853 aa  171  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  44.64 
 
 		 522 aa  155  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  49.67 
 
 		 1478 aa  145  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  47.4 
 
 		 2344 aa  145  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  49.67 
 
 		 1294 aa  144  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  49.67 
 
 		 1414 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  46.62 
 
 		 308 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  49.67 
 
 		 1904 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  45.62 
 
 		 671 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.34 
 
 		 833 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  34.21 
 
 		 590 aa  141  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  41.51 
 
 		 1546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  40.79 
 
 		 1209 aa  124  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  40.67 
 
 		 1121 aa  121  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  39.74 
 
 		 656 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  40.4 
 
 		 1298 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  38.73 
 
 		 732 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  39.74 
 
 		 678 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  39.47 
 
 		 763 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  37.09 
 
 		 467 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  35.53 
 
 		 619 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  34.87 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  35.53 
 
 		 505 aa  102  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  39.22 
 
 		 486 aa  101  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  34.42 
 
 		 1050 aa  99.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  32.52 
 
 		 1013 aa  95.1  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 		 728 aa  94.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  35.97 
 
 		 473 aa  91.3  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  26.27 
 
 		 812 aa  82  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  43.82 
 
 		 1030 aa  79.3  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  32.37 
 
 		 658 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  24.26 
 
 		 571 aa  75.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  23.56 
 
 		 864 aa  73.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  29.66 
 
 		 1224 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  22.43 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 		 649 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  42.55 
 
 		 1937 aa  71.6  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 		 660 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.9 
 
 		 998 aa  70.5  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  23.02 
 
 		 591 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 		 1601 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.65 
 
 		 927 aa  69.3  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  26.05 
 
 		 646 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.34 
 
 		 867 aa  66.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  23.17 
 
 		 1100 aa  65.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  23.66 
 
 		 885 aa  64.3  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  41.03 
 
 		 570 aa  62.4  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  24.54 
 
 		 854 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  23.61 
 
 		 874 aa  58.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 895 aa  57  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.18 
 
 		 582 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  21.74 
 
 		 851 aa  55.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.12 
 
 		 762 aa  55.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  22.44 
 
 		 623 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  24.43 
 
 		 587 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  23.3 
 
 		 906 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  21.89 
 
 		 900 aa  48.9  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  27.78 
 
 		 1069 aa  48.9  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  36.25 
 
 		 632 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  43.86 
 
 		 681 aa  47.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.39 
 
 		 786 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  26.67 
 
 		 833 aa  47  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>