52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0642 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  100 
 
 		 653 aa  1318    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  29.76 
 
 		 1795 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  32.14 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1664  hypothetical protein  25.51 
 
 		 346 aa  97.8  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000631476  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  25.99 
 
 		 1424 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  24.42 
 
 		 1428 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.73 
 
 		 4106 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.79 
 
 		 1505 aa  73.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  24.68 
 
 		 5743 aa  73.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  31.86 
 
 		 2344 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  24.9 
 
 		 4430 aa  71.2  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1121 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1657 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  25.39 
 
 		 3736 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  26.07 
 
 		 3734 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  31.07 
 
 		 3227 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  24.26 
 
 		 1047 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  28.28 
 
 		 857 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1457 aa  60.8  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  22.51 
 
 		 3325 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.34 
 
 		 1332 aa  57.4  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  24.91 
 
 		 1224 aa  56.6  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  25.57 
 
 		 1096 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  25.2 
 
 		 714 aa  53.9  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  22.38 
 
 		 2552 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.44 
 
 		 1641 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  31.68 
 
 		 1197 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1902 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  23.74 
 
 		 3824 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  26.96 
 
 		 2704 aa  52  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.37 
 
 		 3552 aa  51.6  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  23.08 
 
 		 5559 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  23.08 
 
 		 5561 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  23.28 
 
 		 5559 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  23.53 
 
 		 3824 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  28.5 
 
 		 744 aa  50.8  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  22.81 
 
 		 5561 aa  51.2  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1792 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  23.54 
 
 		 675 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0343  hypothetical protein  22.77 
 
 		 913 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1825 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  24.07 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.74 
 
 		 1641 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  24.27 
 
 		 4874 aa  47.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  26.04 
 
 		 3861 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  24.74 
 
 		 3739 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  25.88 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  25.33 
 
 		 1141 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.54 
 
 		 3586 aa  45.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  24.74 
 
 		 3721 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  23.63 
 
 		 3907 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  22.36 
 
 		 4689 aa  44.3  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>