97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0628 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  100 
 
 
1457 aa  2900    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  28.85 
 
 
1219 aa  136  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  28.91 
 
 
1096 aa  121  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  28.51 
 
 
3586 aa  97.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  30.63 
 
 
1047 aa  92  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.94 
 
 
1143 aa  90.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  29.18 
 
 
1152 aa  87  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  24.93 
 
 
1332 aa  83.2  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  28.37 
 
 
1285 aa  82  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.45 
 
 
4106 aa  81.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.66 
 
 
3824 aa  80.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.53 
 
 
3739 aa  80.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.54 
 
 
3824 aa  80.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.7 
 
 
3824 aa  80.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.52 
 
 
5743 aa  77.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  24.97 
 
 
2402 aa  77.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  27.99 
 
 
4689 aa  74.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  28.77 
 
 
827 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25.05 
 
 
5561 aa  70.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  24.84 
 
 
5559 aa  68.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  26.34 
 
 
848 aa  68.6  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  24.84 
 
 
5559 aa  68.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  25.27 
 
 
5561 aa  67  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  28.27 
 
 
3325 aa  67  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  25.27 
 
 
5561 aa  67  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  28.4 
 
 
1362 aa  65.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  27.74 
 
 
3562 aa  65.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  29 
 
 
1141 aa  65.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  27.52 
 
 
898 aa  65.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  30 
 
 
606 aa  65.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.65 
 
 
3552 aa  64.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  29.33 
 
 
3721 aa  63.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  26.86 
 
 
4214 aa  63.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  29.1 
 
 
962 aa  62.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  29.28 
 
 
499 aa  62.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  28.85 
 
 
675 aa  62  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  46.24 
 
 
703 aa  62  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  24.75 
 
 
744 aa  61.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  27.04 
 
 
653 aa  61.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  32.9 
 
 
482 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  22.49 
 
 
1695 aa  60.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  24.58 
 
 
2552 aa  60.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  24.48 
 
 
1452 aa  60.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  32.23 
 
 
952 aa  60.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 
1795 aa  59.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  26.78 
 
 
4430 aa  59.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  22.18 
 
 
1951 aa  59.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  34.21 
 
 
1053 aa  59.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  26.07 
 
 
3925 aa  58.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  20.46 
 
 
1554 aa  58.5  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.95 
 
 
587 aa  57  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  29.03 
 
 
3227 aa  57.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25 
 
 
913 aa  57.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  25.55 
 
 
1224 aa  56.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  35.41 
 
 
549 aa  56.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  30.03 
 
 
899 aa  56.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  26.2 
 
 
846 aa  55.5  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  29.41 
 
 
1278 aa  55.5  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  26.1 
 
 
2704 aa  54.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  32.84 
 
 
2042 aa  53.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  44.44 
 
 
846 aa  52.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  30.12 
 
 
2625 aa  52.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  28.36 
 
 
777 aa  52  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  29.05 
 
 
1129 aa  52  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  33.17 
 
 
1051 aa  52  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  30.22 
 
 
1123 aa  51.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.73 
 
 
1505 aa  50.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  31.74 
 
 
916 aa  50.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  23.94 
 
 
513 aa  50.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  26 
 
 
937 aa  50.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  28.31 
 
 
2927 aa  50.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.41 
 
 
14944 aa  50.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  26.51 
 
 
2456 aa  49.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  34.34 
 
 
491 aa  49.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  26.65 
 
 
4874 aa  49.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.88 
 
 
612 aa  49.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  34.57 
 
 
343 aa  48.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  26.98 
 
 
2350 aa  48.5  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  30.05 
 
 
906 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.04 
 
 
626 aa  48.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  25.91 
 
 
831 aa  48.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.16 
 
 
6683 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  26.16 
 
 
6662 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.08 
 
 
12684 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  32.12 
 
 
606 aa  47.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  28.88 
 
 
1406 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  25.88 
 
 
6779 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.23 
 
 
626 aa  47  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0343  hypothetical protein  25.37 
 
 
913 aa  47  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  31.05 
 
 
606 aa  46.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  21.54 
 
 
892 aa  46.2  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  24.51 
 
 
1146 aa  45.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  36.7 
 
 
2528 aa  45.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  23.99 
 
 
820 aa  45.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  25.35 
 
 
1902 aa  45.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1664  hypothetical protein  25.29 
 
 
346 aa  45.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000631476  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  29.79 
 
 
1054 aa  45.1  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>