37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0346 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  100 
 
 
635 aa  1231    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  94.95 
 
 
1026 aa  1025    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  30.74 
 
 
1657 aa  94.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  39.83 
 
 
1686 aa  77  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  28.42 
 
 
651 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  29.72 
 
 
1825 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.15 
 
 
1627 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  30.03 
 
 
656 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  31.98 
 
 
1762 aa  67  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.97 
 
 
1590 aa  60.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  28.49 
 
 
3925 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  36.94 
 
 
1838 aa  57.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  38.46 
 
 
604 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  34.75 
 
 
1951 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  34.03 
 
 
793 aa  53.9  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  44.32 
 
 
663 aa  53.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  24.07 
 
 
595 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  35.21 
 
 
577 aa  50.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  37.37 
 
 
878 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  32.43 
 
 
978 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  30.43 
 
 
2135 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  32.89 
 
 
2178 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  35.58 
 
 
368 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  25.94 
 
 
352 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  27.44 
 
 
1795 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.97 
 
 
4761 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  34.34 
 
 
637 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  30.63 
 
 
486 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  31.3 
 
 
2117 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  32.95 
 
 
715 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  41.9 
 
 
1121 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.73 
 
 
1669 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  37.97 
 
 
1282 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5902  hypothetical protein  37.35 
 
 
334 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  33.01 
 
 
482 aa  43.9  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.63 
 
 
352 aa  43.9  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  32.38 
 
 
1748 aa  43.9  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>