50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2254 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  100 
 
 		 663 aa  1271    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  53.5 
 
 		 648 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  43.65 
 
 		 651 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  45.2 
 
 		 656 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  33.23 
 
 		 595 aa  198  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  34.94 
 
 		 486 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  35.07 
 
 		 368 aa  130  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  34.84 
 
 		 352 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  30.1 
 
 		 482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  40.93 
 
 		 1627 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.86 
 
 		 1590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.75 
 
 		 1686 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  38.06 
 
 		 412 aa  99  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  37.56 
 
 		 526 aa  94  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  31.52 
 
 		 1762 aa  90.1  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  37.21 
 
 		 1700 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  34.76 
 
 		 4761 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  34.38 
 
 		 1669 aa  82  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  34.7 
 
 		 1183 aa  80.9  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  36.05 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  33.48 
 
 		 810 aa  77.8  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  40 
 
 		 678 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.08 
 
 		 2002 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  35.5 
 
 		 1838 aa  73.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  32 
 
 		 892 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  34.19 
 
 		 693 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.83 
 
 		 2002 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  39.68 
 
 		 631 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  34.22 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1026 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  43.59 
 
 		 665 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  43.59 
 
 		 665 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  28.74 
 
 		 1748 aa  60.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  43.64 
 
 		 1282 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  40.2 
 
 		 635 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  33.79 
 
 		 739 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  34.36 
 
 		 374 aa  55.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.82 
 
 		 2191 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  34.23 
 
 		 2135 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  39.64 
 
 		 1627 aa  53.9  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  30.2 
 
 		 978 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.97 
 
 		 2195 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  27.54 
 
 		 4697 aa  49.7  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  30.29 
 
 		 398 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  35.71 
 
 		 824 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  38.33 
 
 		 536 aa  47.8  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  38.52 
 
 		 3925 aa  47.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  30.8 
 
 		 692 aa  46.6  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  28.06 
 
 		 3340 aa  44.3  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  40.37 
 
 		 1785 aa  43.9  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>