58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1881 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  100 
 
 		 526 aa  998    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  65 
 
 		 1183 aa  276  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  58.18 
 
 		 810 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  39.21 
 
 		 892 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  57.8 
 
 		 410 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  56.05 
 
 		 368 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  56.41 
 
 		 1700 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  48.55 
 
 		 595 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  46.5 
 
 		 482 aa  189  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  46.22 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  46.9 
 
 		 258 aa  182  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  40.94 
 
 		 572 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  42.17 
 
 		 575 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  41.37 
 
 		 575 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.68 
 
 		 752 aa  136  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  38.38 
 
 		 799 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  31.85 
 
 		 1281 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  33.21 
 
 		 449 aa  120  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  36.33 
 
 		 905 aa  120  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  38.46 
 
 		 1316 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  37.4 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  38.02 
 
 		 1180 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  27.85 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  35.94 
 
 		 678 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.92 
 
 		 1776 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  27.64 
 
 		 657 aa  92  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  32.27 
 
 		 374 aa  87  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  36.55 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  34.39 
 
 		 739 aa  80.9  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  33.2 
 
 		 648 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  33.21 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  34.98 
 
 		 631 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  28.52 
 
 		 1361 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  32.99 
 
 		 656 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  48.89 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  27.65 
 
 		 1279 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  47.78 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  37.69 
 
 		 688 aa  64.7  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  35.9 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  27.81 
 
 		 570 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  42.57 
 
 		 536 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0842  putative surface protein  26.92 
 
 		 649 aa  60.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  30.48 
 
 		 651 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  31.67 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 981 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  42.55 
 
 		 1245 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1430  Ig domain-containing protein  36.05 
 
 		 840 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  34.94 
 
 		 932 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  30.45 
 
 		 1821 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0820  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  37.84 
 
 		 683 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  26.52 
 
 		 2638 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  28.89 
 
 		 1009 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 1737 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  23.93 
 
 		 754 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  42.17 
 
 		 1732 aa  44.3  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  29.78 
 
 		 4630 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  34.83 
 
 		 924 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>