47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1017 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  100 
 
 		 486 aa  967    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  64.33 
 
 		 595 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  58.06 
 
 		 482 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  47.08 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  54.67 
 
 		 258 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  46.22 
 
 		 526 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  44.3 
 
 		 810 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  46.35 
 
 		 1183 aa  177  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  31.84 
 
 		 651 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  33 
 
 		 656 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  34.22 
 
 		 663 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  41.99 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  40.97 
 
 		 1700 aa  134  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  30.34 
 
 		 648 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  37.33 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  37.61 
 
 		 1627 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  38.12 
 
 		 1590 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  33.19 
 
 		 1838 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  40.58 
 
 		 739 aa  87.4  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  32.42 
 
 		 693 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  32.89 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  28.96 
 
 		 678 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  33.63 
 
 		 352 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.17 
 
 		 1686 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  37.93 
 
 		 892 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.64 
 
 		 4761 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  35.19 
 
 		 1762 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  34.22 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  40.32 
 
 		 631 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  24 
 
 		 1748 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  40 
 
 		 1026 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.07 
 
 		 1669 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.81 
 
 		 1757 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.61 
 
 		 2191 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  38.68 
 
 		 635 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  30.04 
 
 		 692 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  36.79 
 
 		 1282 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  33.86 
 
 		 2135 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  36.45 
 
 		 685 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1589 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  36.54 
 
 		 978 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.85 
 
 		 995 aa  47.4  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.53 
 
 		 2002 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1068  hypothetical protein  36.51 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.04 
 
 		 2002 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.97 
 
 		 2195 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  26.53 
 
 		 4697 aa  43.1  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>