23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0311 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  798    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  64.2 
 
 		 1183 aa  293  4e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  56.35 
 
 		 810 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  52.15 
 
 		 1700 aa  255  8e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  56.44 
 
 		 526 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  53.6 
 
 		 368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0312  hypothetical protein  79.86 
 
 		 171 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  40.23 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  44.26 
 
 		 482 aa  159  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  41.7 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  39.66 
 
 		 595 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  36.69 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  36.25 
 
 		 678 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  32.39 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  34.65 
 
 		 892 aa  89  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  36.5 
 
 		 739 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  35.34 
 
 		 663 aa  76.6  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  31.91 
 
 		 631 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  32.65 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  33.47 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  30.77 
 
 		 648 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  31.73 
 
 		 651 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0962  hypothetical protein  31.11 
 
 		 138 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal  0.468477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>