93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6600 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  792    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  54.51 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  53.2 
 
 		 254 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  55.14 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  38.12 
 
 		 647 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.5 
 
 		 1015 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  34.76 
 
 		 678 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  38.97 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  33.8 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  38.82 
 
 		 739 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  32.09 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1183 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  35.71 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  28.57 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  29.19 
 
 		 688 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  31.31 
 
 		 846 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  40.16 
 
 		 996 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  37.95 
 
 		 631 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  28.5 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.72 
 
 		 1773 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  29.28 
 
 		 1433 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  32.26 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  32.02 
 
 		 933 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  30.7 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  36.64 
 
 		 686 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  28.33 
 
 		 1575 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  31.91 
 
 		 656 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  38.74 
 
 		 571 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  28.73 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  32.28 
 
 		 1174 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  34.51 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  34.15 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  25.26 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  37.27 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  34.75 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  30.15 
 
 		 571 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1147 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  32.9 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  30.4 
 
 		 810 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.82 
 
 		 665 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  31.52 
 
 		 803 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  28.04 
 
 		 646 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  28.9 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1215 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  34.22 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.05 
 
 		 1296 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1700 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1029 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1294 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  31.03 
 
 		 1437 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  28.31 
 
 		 634 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  32.35 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  29.75 
 
 		 221 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1055 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  28.49 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  28.42 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  28.07 
 
 		 736 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.82 
 
 		 570 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  28.8 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  31.67 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  30.77 
 
 		 757 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  31.51 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  29.63 
 
 		 657 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  25.85 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.27 
 
 		 900 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  26.6 
 
 		 1668 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  28.89 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1003 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  35.37 
 
 		 892 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1087 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2847  hypothetical protein  30.24 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00493413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  26.4 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  27.49 
 
 		 651 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  34.25 
 
 		 595 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  35.59 
 
 		 482 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  33.93 
 
 		 701 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  36.05 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1263 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1318 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.8 
 
 		 1783 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  29.75 
 
 		 648 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  30.89 
 
 		 230 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  31.62 
 
 		 755 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  35.34 
 
 		 523 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  27.48 
 
 		 661 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  25 
 
 		 725 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  25.29 
 
 		 700 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0848  hypothetical protein  37.66 
 
 		 433 aa  46.6  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.4 
 
 		 1797 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  29.94 
 
 		 663 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1782  gamma-D-glutamate-meso-diaminopimelate muropeptidase  33.91 
 
 		 559 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.314104  normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  26.15 
 
 		 728 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>