31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4265 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  100 
 
 
661 aa  1353    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  30.09 
 
 
792 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.92 
 
 
727 aa  190  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  34.29 
 
 
989 aa  188  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4089  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.35 
 
 
720 aa  183  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.498931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.93 
 
 
1068 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.07 
 
 
665 aa  150  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  28.24 
 
 
990 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2257  conserved repeat domain protein  28.61 
 
 
831 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  28.54 
 
 
571 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0122  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.27 
 
 
618 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000207117  normal  0.31182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0120  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  22.57 
 
 
608 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0677  hypothetical protein  24.58 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0150766  normal  0.368163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.94 
 
 
1015 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  26.79 
 
 
347 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  26.98 
 
 
1029 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  22.29 
 
 
477 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  26.85 
 
 
371 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  24.09 
 
 
394 aa  51.2  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  27.48 
 
 
398 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  23.21 
 
 
1215 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  26.89 
 
 
803 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  27.5 
 
 
1433 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  24.55 
 
 
367 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  25.5 
 
 
340 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  26.15 
 
 
324 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  31.31 
 
 
341 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  30.36 
 
 
254 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  28 
 
 
634 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  26.8 
 
 
701 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  23.6 
 
 
1174 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>