157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0502 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  100 
 
 
1575 aa  3198    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  33.27 
 
 
933 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  40.79 
 
 
647 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  37.21 
 
 
634 aa  366  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  30.84 
 
 
2670 aa  332  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  46.27 
 
 
558 aa  325  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  30.54 
 
 
741 aa  301  8e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  31.79 
 
 
3060 aa  278  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  28.91 
 
 
2415 aa  269  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  46.25 
 
 
331 aa  263  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  47.4 
 
 
399 aa  254  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  41.11 
 
 
500 aa  247  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  39.38 
 
 
486 aa  239  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  51.91 
 
 
497 aa  229  3e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  50 
 
 
427 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  38.59 
 
 
1038 aa  217  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  27.07 
 
 
609 aa  216  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  35.37 
 
 
857 aa  216  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  35.26 
 
 
467 aa  214  1e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  35.64 
 
 
395 aa  207  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  36.34 
 
 
907 aa  207  2e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  47.39 
 
 
300 aa  207  2e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  36.43 
 
 
862 aa  201  7.999999999999999e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  38.17 
 
 
377 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  46.47 
 
 
323 aa  200  2.0000000000000003e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  34.19 
 
 
862 aa  200  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  44.67 
 
 
309 aa  196  4e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  34.3 
 
 
898 aa  192  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  43.61 
 
 
253 aa  188  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  38.35 
 
 
789 aa  186  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  39.49 
 
 
800 aa  170  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  36.65 
 
 
279 aa  167  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  36.78 
 
 
934 aa  166  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  29.45 
 
 
450 aa  165  7e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  37.2 
 
 
754 aa  160  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  41.85 
 
 
1294 aa  159  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  51.76 
 
 
173 aa  157  1e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  40.99 
 
 
774 aa  156  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  34.8 
 
 
451 aa  155  7e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  34.8 
 
 
452 aa  155  7e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  48.19 
 
 
250 aa  153  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  44.57 
 
 
250 aa  153  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  47.09 
 
 
226 aa  153  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  47.8 
 
 
251 aa  149  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  39.05 
 
 
399 aa  148  9e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  35.02 
 
 
521 aa  144  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  41.76 
 
 
414 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  40.91 
 
 
1214 aa  142  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  42.68 
 
 
762 aa  140  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  44.67 
 
 
226 aa  127  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  42.38 
 
 
405 aa  127  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  33.19 
 
 
982 aa  125  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  44.44 
 
 
272 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  40.61 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  39.44 
 
 
509 aa  116  3e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.51 
 
 
1227 aa  114  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  35.08 
 
 
1215 aa  108  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  39.74 
 
 
180 aa  107  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  32.68 
 
 
321 aa  105  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  38.71 
 
 
1296 aa  105  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  37.31 
 
 
803 aa  103  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.04 
 
 
570 aa  102  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  33.33 
 
 
200 aa  101  9e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  37.28 
 
 
1174 aa  101  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  52.27 
 
 
913 aa  100  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  37.3 
 
 
1055 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  28.31 
 
 
204 aa  99.8  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  38.96 
 
 
1668 aa  98.6  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  37.29 
 
 
543 aa  97.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  31.2 
 
 
809 aa  97.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  27.91 
 
 
996 aa  97.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  36.08 
 
 
601 aa  95.1  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  37.82 
 
 
658 aa  95.1  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0305  hypothetical protein  47.42 
 
 
496 aa  94.7  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  42.74 
 
 
371 aa  93.6  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  37.1 
 
 
230 aa  93.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29265  predicted protein  47.87 
 
 
236 aa  92.4  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  36.78 
 
 
1433 aa  92.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.52 
 
 
1783 aa  91.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  37.37 
 
 
1029 aa  90.5  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  36.26 
 
 
491 aa  90.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  45.45 
 
 
324 aa  89.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  37.93 
 
 
560 aa  89  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  40.6 
 
 
501 aa  88.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  36.61 
 
 
1437 aa  88.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  39.84 
 
 
221 aa  88.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  34.74 
 
 
394 aa  87.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0173  hypothetical protein  55.71 
 
 
95 aa  87  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  37.67 
 
 
477 aa  86.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  42.5 
 
 
755 aa  84.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  41.18 
 
 
190 aa  84.7  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  44.19 
 
 
228 aa  84.3  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05064  hypothetical protein  46.43 
 
 
158 aa  85.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  34.29 
 
 
1263 aa  84.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  38.85 
 
 
1147 aa  84.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0738  hypothetical protein  37.33 
 
 
446 aa  84.3  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.84 
 
 
665 aa  83.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  33.93 
 
 
1003 aa  82.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  31.4 
 
 
571 aa  82.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  36.91 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>