83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5663 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  663    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  37.43 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  40 
 
 		 1433 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  37.08 
 
 		 755 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  36.11 
 
 		 1668 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  39.08 
 
 		 495 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  37.21 
 
 		 1437 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  37.82 
 
 		 1029 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  36.31 
 
 		 1147 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  35.38 
 
 		 341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  34.07 
 
 		 757 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  36.87 
 
 		 501 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  38.15 
 
 		 1003 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  34.52 
 
 		 657 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  35.33 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  39.63 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  35.71 
 
 		 646 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  37.08 
 
 		 491 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  34.16 
 
 		 996 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  33.9 
 
 		 541 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.25 
 
 		 665 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  31.61 
 
 		 634 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  31.25 
 
 		 1296 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  31.07 
 
 		 1174 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  33.52 
 
 		 700 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  34.86 
 
 		 371 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  36.46 
 
 		 221 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  32.61 
 
 		 736 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  31.84 
 
 		 571 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  33.5 
 
 		 394 aa  95.9  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  31.22 
 
 		 558 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  34.46 
 
 		 1263 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  34.08 
 
 		 477 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  33.69 
 
 		 408 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  30.06 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  29.91 
 
 		 933 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  45.45 
 
 		 1575 aa  89.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1055 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  48.35 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.43 
 
 		 1773 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1215 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.6 
 
 		 1015 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  33.15 
 
 		 601 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  31.68 
 
 		 543 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  33.71 
 
 		 571 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  29.28 
 
 		 803 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  37.72 
 
 		 687 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  28.65 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.36 
 
 		 1797 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.49 
 
 		 900 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  34.22 
 
 		 1294 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28.33 
 
 		 688 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.44 
 
 		 570 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  30.64 
 
 		 686 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  26.54 
 
 		 728 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.29 
 
 		 1783 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  30.43 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  29.21 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  29.31 
 
 		 846 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1318 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  31.39 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  28.8 
 
 		 725 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  27.62 
 
 		 693 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  26.94 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  29.14 
 
 		 876 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  29.59 
 
 		 647 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  29.17 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  30.88 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  32.35 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1484  hypothetical protein  33.04 
 
 		 937 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188972  normal  0.663437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  27.27 
 
 		 701 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  33.9 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  22.64 
 
 		 726 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  25 
 
 		 1059 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3849  Parallel beta-helix repeat protein  39.39 
 
 		 526 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  26.32 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1087 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  26.15 
 
 		 661 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1031 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2589  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  29.93 
 
 		 661 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541867  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  26.67 
 
 		 550 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  32 
 
 		 1093 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3958  Fibronectin type III domain protein  25.97 
 
 		 662 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>