92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0262 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  100 
 
 
200 aa  412  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  53.27 
 
 
204 aa  230  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  48.17 
 
 
898 aa  165  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  43.81 
 
 
486 aa  158  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  47.37 
 
 
741 aa  158  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  43.82 
 
 
754 aa  155  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  39.91 
 
 
857 aa  154  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  42.86 
 
 
800 aa  154  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  42.13 
 
 
762 aa  151  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  40.2 
 
 
862 aa  147  9e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  43.45 
 
 
789 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  40.64 
 
 
609 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  38.21 
 
 
774 aa  142  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  39.09 
 
 
467 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  42.31 
 
 
862 aa  136  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  43.2 
 
 
497 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  39.89 
 
 
395 aa  134  9e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  48.89 
 
 
560 aa  131  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  42.11 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  37.89 
 
 
251 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  40.25 
 
 
250 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  35.16 
 
 
933 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  44.72 
 
 
180 aa  122  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  35.76 
 
 
1038 aa  119  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  41.84 
 
 
323 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  32.54 
 
 
427 aa  115  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  35.33 
 
 
1214 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  33.14 
 
 
300 aa  115  3e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  34.13 
 
 
934 aa  115  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  31.44 
 
 
272 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  42.97 
 
 
414 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  39.04 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  35.46 
 
 
558 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  39.02 
 
 
451 aa  112  3e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  35.58 
 
 
647 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  32.16 
 
 
2670 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0226  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  48.74 
 
 
219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.713864  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  40.38 
 
 
166 aa  109  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  31.88 
 
 
521 aa  108  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  39.41 
 
 
226 aa  108  6e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  39.51 
 
 
452 aa  108  6e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  43.7 
 
 
450 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  33.54 
 
 
377 aa  107  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  39.46 
 
 
309 aa  106  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  30 
 
 
399 aa  105  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  36.76 
 
 
173 aa  105  5e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  33.54 
 
 
399 aa  104  8e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  33.54 
 
 
509 aa  104  8e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  31.52 
 
 
907 aa  103  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  34.19 
 
 
634 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  34.94 
 
 
982 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  34.64 
 
 
253 aa  101  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  27.81 
 
 
2415 aa  101  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  33.33 
 
 
1575 aa  101  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  34.85 
 
 
405 aa  100  1e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  32.75 
 
 
3060 aa  99.8  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  33.55 
 
 
331 aa  99.4  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  35.98 
 
 
275 aa  98.2  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  33.1 
 
 
913 aa  97.1  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0291  hypothetical protein  42.06 
 
 
182 aa  95.5  5e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  33.33 
 
 
500 aa  94.7  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  34.56 
 
 
279 aa  94  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  40.54 
 
 
658 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  38.06 
 
 
371 aa  92.8  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  33.83 
 
 
321 aa  93.2  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.13 
 
 
1227 aa  92  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  39.13 
 
 
288 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0738  hypothetical protein  40.87 
 
 
446 aa  84.7  8e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0444  hypothetical protein  42.57 
 
 
369 aa  81.6  0.000000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.640177  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  34.58 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0308  hypothetical protein  38.02 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  30.56 
 
 
414 aa  79.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0177  hypothetical protein  46.75 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0737  hypothetical protein  34.53 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.442798  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0557  hypothetical protein  40.57 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0736  hypothetical protein  35.94 
 
 
423 aa  77  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29265  predicted protein  39.78 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0305  hypothetical protein  43.66 
 
 
496 aa  74.7  0.0000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0941  protein of unknown function DUF285 lipoprotein  43.82 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.885943  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0212  putative lipoprotein  46.58 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0735  hypothetical protein  44.58 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0173  hypothetical protein  50.72 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05064  hypothetical protein  35.35 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0211  putative lipoprotein  38.1 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  29.89 
 
 
809 aa  63.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0135  hypothetical protein  41.38 
 
 
324 aa  60.1  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0134  hypothetical protein  27.08 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05062  hypothetical protein  42.59 
 
 
109 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0242  putative lipoprotein  26.49 
 
 
762 aa  48.9  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0120138  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0942  adhesion exoprotein  37.36 
 
 
2833 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04560  protein of unknown function, DUF285  21.64 
 
 
283 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.593909  hitchhiker  0.000000409954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>