22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1491 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  100 
 
 
1183 aa  2282    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  63.2 
 
 
1700 aa  726    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  70.7 
 
 
810 aa  303  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  64.31 
 
 
410 aa  299  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  66.82 
 
 
526 aa  281  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  51.33 
 
 
368 aa  241  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  48.88 
 
 
258 aa  186  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  47.21 
 
 
486 aa  178  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  46.58 
 
 
482 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  50.86 
 
 
595 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  38.87 
 
 
412 aa  133  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  35.54 
 
 
678 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  37.9 
 
 
374 aa  107  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  33.03 
 
 
892 aa  105  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  31.66 
 
 
631 aa  85.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  37.78 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  37.78 
 
 
739 aa  79  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  34.41 
 
 
663 aa  75.5  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  32.29 
 
 
648 aa  68.9  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  31.58 
 
 
656 aa  68.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  36.11 
 
 
651 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0848  hypothetical protein  29.52 
 
 
433 aa  47.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>