24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05680 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  703    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  56.88 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  46.44 
 
 		 678 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  48.17 
 
 		 631 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  43.41 
 
 		 739 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  37.89 
 
 		 1183 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  36.11 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  37.27 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  34.33 
 
 		 810 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  32.39 
 
 		 410 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  32.65 
 
 		 1700 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  32.79 
 
 		 892 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  35.9 
 
 		 482 aa  91.3  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  32.42 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  34.51 
 
 		 486 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  33.78 
 
 		 526 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  36 
 
 		 595 aa  87  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  41.22 
 
 		 648 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2847  hypothetical protein  35.44 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00493413 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  35.58 
 
 		 663 aa  69.3  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  35.17 
 
 		 656 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  33.79 
 
 		 651 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2317  hypothetical protein  27.78 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.89603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3251  hypothetical protein  28.26 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>