65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1298 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  100 
 
 		 651 aa  1243    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  81.25 
 
 		 656 aa  959    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  44.66 
 
 		 663 aa  326  9e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  41.01 
 
 		 648 aa  301  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  32.73 
 
 		 595 aa  206  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  31.84 
 
 		 486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.63 
 
 		 1686 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.78 
 
 		 1590 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  36.39 
 
 		 352 aa  127  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.71 
 
 		 1627 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  30.43 
 
 		 482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  34.2 
 
 		 368 aa  120  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  37.66 
 
 		 693 aa  103  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.66 
 
 		 4761 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  30.9 
 
 		 1762 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1026 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  40.41 
 
 		 1700 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1838 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  28.66 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  33.91 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.82 
 
 		 1669 aa  74.3  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.74 
 
 		 2002 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  30.73 
 
 		 3925 aa  67.4  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.44 
 
 		 2195 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  30.48 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.04 
 
 		 2002 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  23.9 
 
 		 1748 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  34.07 
 
 		 2135 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  39.82 
 
 		 1282 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1183 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  33.81 
 
 		 739 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  31.42 
 
 		 631 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  32.46 
 
 		 1577 aa  57.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  33.78 
 
 		 685 aa  57  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 810 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  32.32 
 
 		 824 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  31.22 
 
 		 410 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  26.04 
 
 		 892 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  27.63 
 
 		 398 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  39.05 
 
 		 665 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  29.37 
 
 		 978 aa  55.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  29.38 
 
 		 3586 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  33.78 
 
 		 258 aa  55.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  28.51 
 
 		 692 aa  54.7  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1627 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.98 
 
 		 3977 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  27.8 
 
 		 577 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.21 
 
 		 2191 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  41.33 
 
 		 1785 aa  48.9  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  31.45 
 
 		 767 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  33.56 
 
 		 374 aa  48.9  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  30.77 
 
 		 555 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  22.8 
 
 		 3320 aa  48.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1068  hypothetical protein  39.58 
 
 		 500 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  34.82 
 
 		 536 aa  47.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  28.8 
 
 		 678 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.41 
 
 		 1872 aa  47  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  28.5 
 
 		 766 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  31.93 
 
 		 2024 aa  45.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  34.43 
 
 		 2178 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  31.47 
 
 		 665 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.65 
 
 		 1757 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  33.9 
 
 		 4379 aa  44.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  32.35 
 
 		 14944 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.65 
 
 		 995 aa  43.9  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>