More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1547 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  100 
 
 		 3320 aa  6750    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  49.37 
 
 		 609 aa  396  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  44.39 
 
 		 2375 aa  353  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  42.41 
 
 		 1457 aa  309  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  45.07 
 
 		 2073 aa  255  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1806  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.84 
 
 		 2177 aa  241  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  26.68 
 
 		 2002 aa  233  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.44 
 
 		 631 aa  210  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  31.94 
 
 		 1729 aa  184  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.88 
 
 		 6885 aa  182  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  29.97 
 
 		 2286 aa  146  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  28.93 
 
 		 547 aa  145  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  29.2 
 
 		 2207 aa  141  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1140 aa  131  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  31.71 
 
 		 1042 aa  120  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  39.33 
 
 		 729 aa  117  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  32.12 
 
 		 931 aa  114  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  32.35 
 
 		 739 aa  109  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  27.93 
 
 		 693 aa  107  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.52 
 
 		 1016 aa  105  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.44 
 
 		 1661 aa  102  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1030 aa  100  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  26.82 
 
 		 756 aa  101  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1260 aa  97.1  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0850  hypothetical protein  30.31 
 
 		 428 aa  95.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  25.11 
 
 		 1847 aa  94.4  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  31.27 
 
 		 618 aa  94  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  34.62 
 
 		 1013 aa  91.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1889  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.18 
 
 		 414 aa  90.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000270589  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  23.96 
 
 		 4697 aa  90.5  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  27.05 
 
 		 766 aa  90.5  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1938  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  32.18 
 
 		 414 aa  89.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000112204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  31.32 
 
 		 930 aa  88.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  25.97 
 
 		 1567 aa  87.8  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  23.74 
 
 		 548 aa  87.8  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  29.37 
 
 		 1121 aa  87  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  28.9 
 
 		 530 aa  87  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  31.98 
 
 		 1495 aa  85.9  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  28.73 
 
 		 2178 aa  86.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 		 1121 aa  84.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  27.97 
 
 		 1121 aa  82.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.21 
 
 		 529 aa  82  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000810888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0841  S-layer protein Sap  28.9 
 
 		 814 aa  82  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  31.15 
 
 		 414 aa  82  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  30.32 
 
 		 779 aa  82.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0885  s-layer protein sap  28.9 
 
 		 814 aa  82  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0789  S-layer protein sap precursor  28.9 
 
 		 814 aa  81.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.21 
 
 		 529 aa  80.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000334554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.21 
 
 		 529 aa  80.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000328713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  25.89 
 
 		 524 aa  80.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  27.53 
 
 		 760 aa  80.5  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  22.6 
 
 		 692 aa  80.5  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1682  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.06 
 
 		 414 aa  80.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000845994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  30.06 
 
 		 413 aa  80.1  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1817  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.06 
 
 		 414 aa  80.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000725042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  30.06 
 
 		 414 aa  80.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.72375e-61 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1194 aa  80.1  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.09 
 
 		 529 aa  79.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.09 
 
 		 529 aa  79.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000657012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  29.38 
 
 		 520 aa  79.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.09 
 
 		 529 aa  79.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000140449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  29.76 
 
 		 921 aa  78.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  30.93 
 
 		 1226 aa  78.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  26.97 
 
 		 760 aa  79  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  30.98 
 
 		 1009 aa  78.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40470  predicted protein  33.12 
 
 		 256 aa  78.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  30.34 
 
 		 880 aa  77.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  27.37 
 
 		 772 aa  78.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  28.09 
 
 		 538 aa  78.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  28.57 
 
 		 932 aa  77.8  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0045  surface-layer n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase  30.9 
 
 		 531 aa  77.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000055922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0089  S-layer domain protein  27.65 
 
 		 807 aa  77.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025043 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  28.81 
 
 		 807 aa  77  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  26.97 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  26.97 
 
 		 765 aa  76.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  41.82 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3020  hypothetical protein  48.81 
 
 		 1250 aa  76.3  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54139  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  28.57 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  27.17 
 
 		 535 aa  75.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  30.53 
 
 		 404 aa  76.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3790999999999998e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.08 
 
 		 1054 aa  76.3  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  28.32 
 
 		 527 aa  75.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  27.17 
 
 		 535 aa  75.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  30.15 
 
 		 554 aa  75.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  28.16 
 
 		 914 aa  75.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0903  S-layer protein  26.67 
 
 		 379 aa  75.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  28.57 
 
 		 573 aa  74.3  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  27.51 
 
 		 484 aa  74.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 		 1112 aa  74.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  47.92 
 
 		 848 aa  73.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0796  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.78 
 
 		 540 aa  73.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.06495e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  28.91 
 
 		 413 aa  73.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  26.4 
 
 		 779 aa  73.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  28.73 
 
 		 733 aa  73.2  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3093  S-layer protein  28.09 
 
 		 360 aa  73.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000122253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3079  S-layer domain-containing protein  31.53 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00407432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  28.09 
 
 		 360 aa  73.2  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 1321 aa  73.2  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  28.09 
 
 		 360 aa  73.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  28.09 
 
 		 360 aa  72.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>