51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2743 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 352 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  34.92 
 
 		 651 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  35.62 
 
 		 656 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  32.74 
 
 		 595 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  30.23 
 
 		 1762 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  35.24 
 
 		 663 aa  96.7  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.7 
 
 		 1590 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.44 
 
 		 1686 aa  93.2  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  38.32 
 
 		 693 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  34.8 
 
 		 1627 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.68 
 
 		 2002 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  32.65 
 
 		 665 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  29.92 
 
 		 648 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  29.01 
 
 		 3925 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  38.54 
 
 		 665 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  33.01 
 
 		 4761 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  31.52 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  32.29 
 
 		 1838 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  46 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.87 
 
 		 1757 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  32.93 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  28.51 
 
 		 692 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.66 
 
 		 2191 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.55 
 
 		 2002 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0715  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.17 
 
 		 1708 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1026 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.86 
 
 		 2195 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  35.24 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  23.17 
 
 		 1748 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.86 
 
 		 1669 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  38.46 
 
 		 685 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  38.94 
 
 		 536 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  35.4 
 
 		 767 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  39.8 
 
 		 3586 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  28.84 
 
 		 4697 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  23.72 
 
 		 3320 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.34 
 
 		 995 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1947  hypothetical protein  36.9 
 
 		 483 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  37.39 
 
 		 1627 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  25.94 
 
 		 635 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  29.81 
 
 		 978 aa  49.3  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  30.84 
 
 		 2178 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  32.12 
 
 		 873 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  32.14 
 
 		 1577 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  38 
 
 		 1785 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  34.48 
 
 		 824 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.17 
 
 		 3977 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  32.77 
 
 		 4379 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  28.94 
 
 		 2402 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  29.17 
 
 		 1587 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1282 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>