16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1947 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1947  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  967    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4224  hypothetical protein  42.11 
 
 
484 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.00924155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3210  hypothetical protein  38.99 
 
 
496 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.790866  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2476  hypothetical protein  37.57 
 
 
516 aa  327  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00638896  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0064  hypothetical protein  38.98 
 
 
500 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4806  hypothetical protein  37.88 
 
 
513 aa  325  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1481  hypothetical protein  39.53 
 
 
499 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1508  hypothetical protein  39.53 
 
 
499 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1925  hypothetical protein  32.87 
 
 
507 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0608  hypothetical protein  33.86 
 
 
484 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0624  hypothetical protein  33.86 
 
 
484 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  36.9 
 
 
352 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5077  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.51 
 
 
297 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167981  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.71 
 
 
1598 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.11 
 
 
1617 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.83 
 
 
1583 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>