58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3205 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  58.99 
 
 		 4830 aa  862    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  75.64 
 
 		 819 aa  1065    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  55.32 
 
 		 764 aa  636    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  100 
 
 		 873 aa  1736    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  61.69 
 
 		 889 aa  938    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  58.62 
 
 		 3864 aa  858    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  58.59 
 
 		 768 aa  678    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  57.03 
 
 		 770 aa  668    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  58.61 
 
 		 1196 aa  884    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  64.61 
 
 		 7434 aa  945    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  76.77 
 
 		 768 aa  975    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  57.59 
 
 		 860 aa  872    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  89.71 
 
 		 781 aa  1132    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  54.63 
 
 		 790 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  81.94 
 
 		 756 aa  1032    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  53.1 
 
 		 777 aa  609  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  53.09 
 
 		 763 aa  596  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  58.63 
 
 		 918 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  60.78 
 
 		 465 aa  485  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  55.97 
 
 		 954 aa  389  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  80.3 
 
 		 479 aa  315  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  42.88 
 
 		 846 aa  311  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  48.02 
 
 		 3340 aa  280  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  40.16 
 
 		 4428 aa  275  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  50 
 
 		 1641 aa  273  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  46.04 
 
 		 2796 aa  259  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  78.77 
 
 		 145 aa  238  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.38 
 
 		 2156 aa  228  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  36.8 
 
 		 3066 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  49.07 
 
 		 1099 aa  177  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  34.48 
 
 		 5442 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  40.18 
 
 		 1526 aa  134  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  34.86 
 
 		 2768 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  37.28 
 
 		 4697 aa  110  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  35.23 
 
 		 308 aa  94.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  34.64 
 
 		 1699 aa  90.9  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.89 
 
 		 2839 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  30.42 
 
 		 2886 aa  80.1  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1151 aa  77  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  36.22 
 
 		 1827 aa  71.2  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  41.74 
 
 		 2193 aa  70.5  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1902 aa  65.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.03 
 
 		 4480 aa  63.9  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.99 
 
 		 1627 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  31.08 
 
 		 2194 aa  63.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  31.69 
 
 		 1359 aa  62  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  33.05 
 
 		 852 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  32.4 
 
 		 3227 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  27.68 
 
 		 3146 aa  52.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  45.1 
 
 		 2927 aa  49.7  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.39 
 
 		 2503 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  29.39 
 
 		 3699 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  23.7 
 
 		 3470 aa  48.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  33.79 
 
 		 352 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 4678 aa  47.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1321 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  29.94 
 
 		 692 aa  44.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  29.14 
 
 		 746 aa  44.3  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>