51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1130 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  52.57 
 
 		 770 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  54.8 
 
 		 790 aa  711    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  80.59 
 
 		 756 aa  1142    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  72.53 
 
 		 781 aa  1021    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  60.98 
 
 		 3864 aa  823    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  67.63 
 
 		 819 aa  945    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  55.15 
 
 		 764 aa  715    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  76.66 
 
 		 873 aa  959    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  51.07 
 
 		 889 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  50.5 
 
 		 768 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  66.33 
 
 		 1196 aa  912    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  64.74 
 
 		 7434 aa  887    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  54.78 
 
 		 777 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  100 
 
 		 768 aa  1538    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  73.86 
 
 		 860 aa  927    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  60.38 
 
 		 4830 aa  806    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  49.69 
 
 		 763 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  59.1 
 
 		 918 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  63.2 
 
 		 465 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  53.31 
 
 		 954 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  45.19 
 
 		 846 aa  317  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  77.27 
 
 		 479 aa  297  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  50.64 
 
 		 4428 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  47.85 
 
 		 3340 aa  280  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  50.56 
 
 		 1641 aa  270  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  88.28 
 
 		 145 aa  267  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  47.23 
 
 		 2796 aa  261  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.53 
 
 		 2156 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  48.96 
 
 		 1099 aa  168  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  33.97 
 
 		 3066 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  32.02 
 
 		 5442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  34 
 
 		 4697 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  36.59 
 
 		 308 aa  110  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.23 
 
 		 2768 aa  99.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  31.83 
 
 		 1699 aa  80.5  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  32.13 
 
 		 2839 aa  79  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  35.53 
 
 		 2886 aa  67.4  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  42.05 
 
 		 2193 aa  64.3  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  33.64 
 
 		 1359 aa  62  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1902 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  32.73 
 
 		 1827 aa  57  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.56 
 
 		 1627 aa  57.4  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  30.64 
 
 		 2927 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  32.81 
 
 		 2194 aa  54.7  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  27.72 
 
 		 746 aa  54.3  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.94 
 
 		 852 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  30.62 
 
 		 4678 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1151 aa  47.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1321 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  29.11 
 
 		 2233 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>