56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2195 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  100 
 
 		 1151 aa  2330    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  43.05 
 
 		 2156 aa  105  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  38.01 
 
 		 3066 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  41.84 
 
 		 1699 aa  102  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  43.5 
 
 		 2839 aa  100  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.31 
 
 		 4480 aa  98.2  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  39.45 
 
 		 4697 aa  92.4  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  35.71 
 
 		 5442 aa  92  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  38.77 
 
 		 1526 aa  91.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  40.91 
 
 		 2886 aa  86.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.67 
 
 		 2768 aa  84  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  35.19 
 
 		 1196 aa  83.2  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  36.73 
 
 		 7434 aa  80.9  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  35.34 
 
 		 918 aa  80.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  33.45 
 
 		 873 aa  79  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  37.19 
 
 		 1359 aa  78.6  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  35.34 
 
 		 4830 aa  78.6  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  35.34 
 
 		 3864 aa  78.6  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  33.58 
 
 		 781 aa  77  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  35.53 
 
 		 860 aa  76.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  31.13 
 
 		 889 aa  72  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  34.65 
 
 		 954 aa  70.1  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  36.84 
 
 		 756 aa  68.6  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  36.57 
 
 		 3340 aa  67  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  32.09 
 
 		 917 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  23.7 
 
 		 1143 aa  62.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  28.99 
 
 		 3132 aa  62.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.8 
 
 		 2927 aa  60.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  31.67 
 
 		 940 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  40.28 
 
 		 1022 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  32.32 
 
 		 763 aa  56.6  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  36.08 
 
 		 1017 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  34.25 
 
 		 2194 aa  56.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  35.11 
 
 		 938 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.11 
 
 		 14916 aa  55.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  40.5 
 
 		 819 aa  55.5  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  36.08 
 
 		 8980 aa  55.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  31.73 
 
 		 3508 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  41.25 
 
 		 813 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.91 
 
 		 3227 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  28.57 
 
 		 1019 aa  52.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  32.68 
 
 		 1092 aa  51.6  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.33 
 
 		 3089 aa  50.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  24.31 
 
 		 4465 aa  51.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 		 3363 aa  48.9  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  30.15 
 
 		 1827 aa  48.5  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  31.11 
 
 		 846 aa  48.1  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  37.39 
 
 		 770 aa  48.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  38.03 
 
 		 768 aa  47.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  37.35 
 
 		 1838 aa  48.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  38.26 
 
 		 768 aa  46.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  30.3 
 
 		 16311 aa  46.2  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  26.53 
 
 		 6678 aa  46.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.83 
 
 		 3427 aa  46.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  25.2 
 
 		 337 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  35.71 
 
 		 764 aa  45.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>