52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1524 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  68.84 
 
 		 846 aa  732    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  53.54 
 
 		 1196 aa  680    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  100 
 
 		 777 aa  1562    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  51.51 
 
 		 4830 aa  668    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  54.91 
 
 		 768 aa  673    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  51.39 
 
 		 860 aa  663    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  52.21 
 
 		 756 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  68.75 
 
 		 770 aa  914    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  56.87 
 
 		 790 aa  782    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  69.75 
 
 		 768 aa  940    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  54.31 
 
 		 763 aa  679    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  60.98 
 
 		 764 aa  874    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  52.15 
 
 		 3864 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  55.01 
 
 		 889 aa  615  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  71.24 
 
 		 465 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  53.39 
 
 		 873 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  48.68 
 
 		 781 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  48.75 
 
 		 7434 aa  586  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  49.27 
 
 		 819 aa  573  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  59.26 
 
 		 479 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  49.67 
 
 		 918 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  41.65 
 
 		 954 aa  337  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  38.07 
 
 		 4428 aa  305  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  49.12 
 
 		 3340 aa  281  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  90.34 
 
 		 145 aa  275  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  51.96 
 
 		 1641 aa  262  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  47.51 
 
 		 2796 aa  260  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  44.59 
 
 		 308 aa  195  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.47 
 
 		 2156 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  36.44 
 
 		 3066 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  47.92 
 
 		 1099 aa  163  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  32.76 
 
 		 1526 aa  140  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  31.28 
 
 		 5442 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  30.88 
 
 		 2768 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  30.1 
 
 		 4697 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  29.19 
 
 		 1699 aa  67.4  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  31.61 
 
 		 1827 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  32.63 
 
 		 2193 aa  65.1  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  26.49 
 
 		 2839 aa  60.8  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  38.02 
 
 		 2927 aa  58.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.9 
 
 		 4480 aa  57.8  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1902 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.36 
 
 		 852 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  29.1 
 
 		 1359 aa  56.2  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  27.42 
 
 		 746 aa  51.2  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1321 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  28.14 
 
 		 2194 aa  47  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.37 
 
 		 3227 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  36.52 
 
 		 1151 aa  45.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  32.54 
 
 		 1586 aa  45.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.31 
 
 		 1627 aa  45.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  28.75 
 
 		 2886 aa  44.3  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>