58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0160 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 2156 aa  4024    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  69.11 
 
 		 3066 aa  2117    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  41.64 
 
 		 3864 aa  1330    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  45.96 
 
 		 5442 aa  1202    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  42.72 
 
 		 7434 aa  1333    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  41.89 
 
 		 4830 aa  1345    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  39.23 
 
 		 1196 aa  457  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  35.17 
 
 		 4480 aa  413  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  38.22 
 
 		 918 aa  381  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  42.59 
 
 		 1526 aa  361  7e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  42.27 
 
 		 2768 aa  303  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  35.77 
 
 		 1699 aa  266  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  37.92 
 
 		 860 aa  256  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  26.25 
 
 		 4697 aa  243  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  30.95 
 
 		 2886 aa  241  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  36.23 
 
 		 954 aa  226  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  36.15 
 
 		 889 aa  219  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  38 
 
 		 873 aa  211  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  39.36 
 
 		 3340 aa  206  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  35.18 
 
 		 846 aa  191  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  37.01 
 
 		 790 aa  190  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  37.7 
 
 		 781 aa  189  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  36.51 
 
 		 1902 aa  184  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  36.18 
 
 		 819 aa  182  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  37.27 
 
 		 763 aa  180  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  34.66 
 
 		 770 aa  181  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  36.47 
 
 		 777 aa  177  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  28.86 
 
 		 2194 aa  178  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  34.41 
 
 		 756 aa  177  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  32.53 
 
 		 768 aa  170  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  28.44 
 
 		 3227 aa  170  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  35.62 
 
 		 764 aa  166  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  33.11 
 
 		 768 aa  159  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  32.25 
 
 		 1359 aa  130  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 		 4678 aa  125  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  60.75 
 
 		 1827 aa  113  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  58.33 
 
 		 2193 aa  109  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  37.36 
 
 		 2839 aa  105  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  43.72 
 
 		 1151 aa  103  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  29.61 
 
 		 2802 aa  93.2  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  33.58 
 
 		 308 aa  91.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.35 
 
 		 2927 aa  84.7  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  45.13 
 
 		 465 aa  77  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  33.45 
 
 		 852 aa  75.5  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.47 
 
 		 1627 aa  72.8  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  24.61 
 
 		 5444 aa  72  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  32.42 
 
 		 1641 aa  71.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  31.33 
 
 		 4428 aa  66.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  23.72 
 
 		 3470 aa  62  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  25 
 
 		 2625 aa  61.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  40.86 
 
 		 479 aa  60.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  26.15 
 
 		 4689 aa  57  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  27.81 
 
 		 2233 aa  56.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  32.52 
 
 		 1092 aa  56.2  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  24.93 
 
 		 3736 aa  54.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.02 
 
 		 1143 aa  48.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  28.43 
 
 		 3721 aa  47  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.13 
 
 		 1590 aa  46.6  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>