36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2861 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  43.95 
 
 
3340 aa  763    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  100 
 
 
1641 aa  3293    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  42.05 
 
 
2796 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  41.54 
 
 
4428 aa  620  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  52.51 
 
 
860 aa  317  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  51.12 
 
 
768 aa  309  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  51.12 
 
 
756 aa  305  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  51.94 
 
 
1196 aa  305  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  52.57 
 
 
777 aa  291  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  48.07 
 
 
790 aa  290  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  49.6 
 
 
7434 aa  288  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  49.46 
 
 
873 aa  287  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  50.76 
 
 
764 aa  284  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  51.35 
 
 
770 aa  283  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  48.55 
 
 
819 aa  283  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  49.19 
 
 
3864 aa  279  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  48.16 
 
 
781 aa  278  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  50.45 
 
 
768 aa  274  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  49.71 
 
 
889 aa  273  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  47.98 
 
 
4830 aa  272  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  46.81 
 
 
763 aa  251  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  44.41 
 
 
465 aa  241  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  41.24 
 
 
1099 aa  235  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  57.07 
 
 
954 aa  207  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  62.5 
 
 
145 aa  191  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  58.02 
 
 
479 aa  189  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  34.08 
 
 
846 aa  100  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  45.14 
 
 
918 aa  85.9  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.42 
 
 
2156 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.88 
 
 
3066 aa  69.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  43.44 
 
 
1526 aa  60.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  24.78 
 
 
4697 aa  56.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  35.71 
 
 
5442 aa  53.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  27.38 
 
 
746 aa  52.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  31.01 
 
 
4723 aa  50.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  31.97 
 
 
2193 aa  48.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>