153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2273 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 1827 aa  3676    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  49.81 
 
 		 1434 aa  320  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.48 
 
 		 11716 aa  290  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  48.72 
 
 		 702 aa  269  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  46.42 
 
 		 640 aa  250  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  44.31 
 
 		 621 aa  229  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  39.37 
 
 		 937 aa  190  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.31 
 
 		 2507 aa  163  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  33.42 
 
 		 1437 aa  161  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  39.41 
 
 		 706 aa  160  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  32.78 
 
 		 2064 aa  160  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  35.78 
 
 		 1337 aa  157  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  36.23 
 
 		 1348 aa  157  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  39.31 
 
 		 935 aa  149  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  32.79 
 
 		 811 aa  142  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  32.8 
 
 		 1346 aa  142  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  33.42 
 
 		 1433 aa  139  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  34.87 
 
 		 503 aa  128  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  37 
 
 		 885 aa  124  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  30.53 
 
 		 819 aa  122  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.47 
 
 		 1073 aa  121  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  61.68 
 
 		 2156 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  47.74 
 
 		 3066 aa  112  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  31.38 
 
 		 752 aa  111  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  59.05 
 
 		 1526 aa  110  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  26.74 
 
 		 749 aa  104  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  36.04 
 
 		 5442 aa  90.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.5 
 
 		 2768 aa  88.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  43.84 
 
 		 2193 aa  85.5  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  43 
 
 		 1699 aa  84.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.37 
 
 		 2927 aa  74.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.25 
 
 		 2839 aa  74.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  34.78 
 
 		 873 aa  71.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  46.07 
 
 		 3834 aa  71.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.82 
 
 		 3314 aa  70.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  34.24 
 
 		 781 aa  68.6  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  43.59 
 
 		 3340 aa  68.6  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  32.13 
 
 		 4830 aa  67.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  41.28 
 
 		 7434 aa  68.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  34.31 
 
 		 846 aa  67.4  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  42.2 
 
 		 3864 aa  66.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.65 
 
 		 2812 aa  66.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  35.71 
 
 		 3736 aa  65.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  37.8 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  40.54 
 
 		 2024 aa  65.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  38.53 
 
 		 860 aa  65.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  37.59 
 
 		 819 aa  64.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.63 
 
 		 3323 aa  64.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  33.75 
 
 		 954 aa  62.8  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  37.1 
 
 		 1196 aa  61.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  40.35 
 
 		 918 aa  62  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  32.12 
 
 		 770 aa  60.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  31.68 
 
 		 777 aa  60.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  34.01 
 
 		 889 aa  59.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  41.57 
 
 		 3734 aa  58.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  32.73 
 
 		 768 aa  57.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  40.2 
 
 		 756 aa  57  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0757  hypothetical protein  32.14 
 
 		 386 aa  57  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00827619  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  33.08 
 
 		 4697 aa  56.2  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.83 
 
 		 2678 aa  55.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  35.29 
 
 		 2689 aa  55.5  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2271  Hemolysin-type calcium-binding region  54.69 
 
 		 272 aa  55.5  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.820331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 		 1795 aa  55.5  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  28.47 
 
 		 768 aa  55.5  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  30.43 
 
 		 466 aa  53.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0748  hypothetical protein  31.89 
 
 		 381 aa  53.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.205033  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  39.45 
 
 		 4106 aa  53.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  31.61 
 
 		 2097 aa  52.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  32.86 
 
 		 500 aa  52.4  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  36.73 
 
 		 1532 aa  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  36.75 
 
 		 4798 aa  52  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 		 621 aa  52  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  29.1 
 
 		 1359 aa  51.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  38.38 
 
 		 2105 aa  51.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3148  hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 		 493 aa  51.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0237525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  28.21 
 
 		 556 aa  51.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 		 1534 aa  51.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.93 
 
 		 5839 aa  51.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.61 
 
 		 2807 aa  50.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  36.27 
 
 		 790 aa  51.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 982 aa  50.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.58 
 
 		 3977 aa  50.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  27.93 
 
 		 8980 aa  50.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  27.13 
 
 		 2911 aa  50.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  33.79 
 
 		 2345 aa  49.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  27.13 
 
 		 3204 aa  49.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  32.84 
 
 		 243 aa  50.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.61 
 
 		 1363 aa  49.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0797  hypothetical protein  30.08 
 
 		 300 aa  49.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  33.86 
 
 		 518 aa  49.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  38.3 
 
 		 4800 aa  49.3  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  38.24 
 
 		 327 aa  49.3  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  36.56 
 
 		 2182 aa  48.9  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0768  hypothetical protein  30.77 
 
 		 385 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  31.13 
 
 		 7284 aa  48.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1424 aa  48.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  32.84 
 
 		 2667 aa  48.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.58 
 
 		 1279 aa  48.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  32 
 
 		 813 aa  48.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.54 
 
 		 3427 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>