56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4144 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  67.96 
 
 
7434 aa  904    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  100 
 
 
781 aa  1551    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  62.34 
 
 
3864 aa  836    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  77.47 
 
 
819 aa  1088    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  51.99 
 
 
764 aa  675    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  89.86 
 
 
873 aa  1130    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  57.55 
 
 
889 aa  683    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  74.65 
 
 
756 aa  1058    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  54.41 
 
 
768 aa  708    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  55.21 
 
 
770 aa  700    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  61.88 
 
 
1196 aa  850    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  63.02 
 
 
4830 aa  850    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  72.53 
 
 
768 aa  1036    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  67.3 
 
 
860 aa  834    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  50 
 
 
790 aa  633  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  48.43 
 
 
777 aa  608  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  49.14 
 
 
763 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  61.11 
 
 
918 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  59.7 
 
 
465 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  52.62 
 
 
954 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  41.32 
 
 
846 aa  324  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  77.39 
 
 
479 aa  305  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  44.29 
 
 
3340 aa  270  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  39.17 
 
 
4428 aa  264  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  48.68 
 
 
1641 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  44.64 
 
 
2796 aa  250  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  75.51 
 
 
145 aa  229  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  36.2 
 
 
3066 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.7 
 
 
2156 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  49.47 
 
 
1099 aa  166  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  35.88 
 
 
5442 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  39.26 
 
 
1526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  32.7 
 
 
2768 aa  125  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  36.05 
 
 
4697 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  38.08 
 
 
308 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  33.74 
 
 
1699 aa  91.3  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.43 
 
 
2839 aa  77  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  32.78 
 
 
1151 aa  76.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  42.61 
 
 
2193 aa  72.8  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  30.23 
 
 
2886 aa  68.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  35.68 
 
 
1827 aa  68.2  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.88 
 
 
4480 aa  65.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  30.56 
 
 
2194 aa  65.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  32.67 
 
 
1359 aa  63.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.7 
 
 
1627 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.16 
 
 
852 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  32.09 
 
 
1902 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  31.31 
 
 
2233 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  32.17 
 
 
3227 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  45.1 
 
 
2927 aa  48.9  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  32.52 
 
 
4678 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  28.66 
 
 
1321 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.33 
 
 
2503 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  29.33 
 
 
3699 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  23.48 
 
 
3470 aa  45.8  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  28.48 
 
 
746 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>