49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1980 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  54.29 
 
 		 781 aa  690    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  54.42 
 
 		 3864 aa  707    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  52.47 
 
 		 819 aa  669    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  54.68 
 
 		 763 aa  696    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  74.29 
 
 		 764 aa  1105    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  58.3 
 
 		 873 aa  656    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  60.4 
 
 		 889 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  65.24 
 
 		 846 aa  658    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  58.05 
 
 		 790 aa  790    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  100 
 
 		 768 aa  1540    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  51.92 
 
 		 756 aa  655    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  82.02 
 
 		 770 aa  1202    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  50.25 
 
 		 768 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  54.77 
 
 		 4830 aa  706    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  69.61 
 
 		 777 aa  944    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  51 
 
 		 7434 aa  627  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  48.68 
 
 		 1196 aa  623  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  74.13 
 
 		 918 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  51.6 
 
 		 860 aa  569  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  66.52 
 
 		 465 aa  567  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  88.24 
 
 		 954 aa  355  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  74.24 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  39.65 
 
 		 4428 aa  287  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  44.78 
 
 		 3340 aa  278  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  51.65 
 
 		 1641 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  43.94 
 
 		 2796 aa  258  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  80 
 
 		 145 aa  248  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  47.78 
 
 		 308 aa  222  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  46.4 
 
 		 1099 aa  172  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.11 
 
 		 2156 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.14 
 
 		 3066 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1526 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  29.3 
 
 		 2768 aa  97.4  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  30.5 
 
 		 5442 aa  91.3  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  33.8 
 
 		 4697 aa  90.9  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  37.84 
 
 		 2193 aa  64.7  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  38.76 
 
 		 2927 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.82 
 
 		 852 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  29.55 
 
 		 1699 aa  58.5  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.77 
 
 		 2839 aa  57.8  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  28.65 
 
 		 1359 aa  57.8  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  28.47 
 
 		 1827 aa  55.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  32.29 
 
 		 1902 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  31.18 
 
 		 2886 aa  47.8  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.48 
 
 		 4480 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 		 4678 aa  47.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  38.26 
 
 		 1151 aa  46.6  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  31.21 
 
 		 4009 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  34.15 
 
 		 1586 aa  44.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>