29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2037 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  53.58 
 
 
764 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  54.61 
 
 
1196 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  53.42 
 
 
918 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  53.22 
 
 
846 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  49.32 
 
 
770 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  47.78 
 
 
768 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  56.35 
 
 
7434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  44.59 
 
 
777 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  43.1 
 
 
3864 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  43.1 
 
 
4830 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  39.34 
 
 
790 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  40.68 
 
 
763 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  43.86 
 
 
889 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  36.18 
 
 
768 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  31.68 
 
 
954 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  37.24 
 
 
781 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  32.65 
 
 
756 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  36.82 
 
 
860 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.31 
 
 
2156 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  34.2 
 
 
873 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  30.69 
 
 
819 aa  86.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  31.21 
 
 
1526 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  29.55 
 
 
3066 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  28.84 
 
 
2768 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  29.02 
 
 
5442 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  28 
 
 
3340 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  25.81 
 
 
2193 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  28.11 
 
 
1359 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>