57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1974 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  66.07 
 
 		 860 aa  1059    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  64.04 
 
 		 873 aa  932    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  65.29 
 
 		 918 aa  944    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  49.89 
 
 		 889 aa  697    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  50.19 
 
 		 790 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  51.63 
 
 		 768 aa  643    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  53.24 
 
 		 770 aa  653    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  62.41 
 
 		 1196 aa  1340    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  100 
 
 		 7434 aa  14540    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  68.15 
 
 		 4830 aa  5955    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  64.49 
 
 		 768 aa  906    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  76.58 
 
 		 3864 aa  5569    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  64.92 
 
 		 756 aa  891    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  41.89 
 
 		 2156 aa  1269    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  39.42 
 
 		 3066 aa  1060    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  67.71 
 
 		 781 aa  902    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  40.97 
 
 		 5442 aa  1384    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  67.08 
 
 		 819 aa  901    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  48.89 
 
 		 764 aa  632  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  47.76 
 
 		 777 aa  598  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  49.75 
 
 		 763 aa  587  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  50.07 
 
 		 954 aa  523  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  59.52 
 
 		 465 aa  479  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  36.78 
 
 		 1699 aa  328  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.78 
 
 		 4480 aa  320  9e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  76.77 
 
 		 479 aa  305  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  41.43 
 
 		 846 aa  300  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  24.99 
 
 		 4697 aa  294  5.0000000000000004e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  46.31 
 
 		 3340 aa  277  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  48.35 
 
 		 4428 aa  275  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  50 
 
 		 1641 aa  272  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  45.32 
 
 		 2796 aa  261  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  32.67 
 
 		 2886 aa  257  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  77.4 
 
 		 145 aa  238  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  26.08 
 
 		 4678 aa  237  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  34.53 
 
 		 1526 aa  234  6e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  38.98 
 
 		 2768 aa  209  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  56.35 
 
 		 308 aa  198  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  51.3 
 
 		 1099 aa  175  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  25.7 
 
 		 2194 aa  117  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  31.06 
 
 		 1359 aa  112  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  35.41 
 
 		 2839 aa  103  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1902 aa  103  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  26.92 
 
 		 3227 aa  99.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  28.69 
 
 		 2927 aa  97.1  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  39.36 
 
 		 1151 aa  80.9  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  30.03 
 
 		 852 aa  79.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  27.31 
 
 		 2795 aa  78.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  27.84 
 
 		 1976 aa  77  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  45 
 
 		 2193 aa  73.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  31.28 
 
 		 1827 aa  72.4  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.16 
 
 		 1627 aa  72.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  27.04 
 
 		 3146 aa  63.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  23.43 
 
 		 3470 aa  63.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  40.74 
 
 		 1586 aa  59.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  32.55 
 
 		 1092 aa  55.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  25.16 
 
 		 822 aa  49.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>