59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1994 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  100 
 
 		 1321 aa  2595    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  37.92 
 
 		 746 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1024 aa  94.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 253 aa  77.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 257 aa  76.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  43.27 
 
 		 1394 aa  70.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1314 aa  68.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  45.71 
 
 		 2082 aa  65.1  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  42.06 
 
 		 654 aa  64.3  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  47.76 
 
 		 14609 aa  62.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  47.14 
 
 		 873 aa  61.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  42.55 
 
 		 1332 aa  61.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.06 
 
 		 1482 aa  59.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  44.76 
 
 		 1487 aa  59.3  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  40 
 
 		 717 aa  57.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  51.52 
 
 		 682 aa  56.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1017 aa  55.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  33.78 
 
 		 489 aa  54.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  50.98 
 
 		 593 aa  54.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  40.23 
 
 		 679 aa  53.5  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  48.61 
 
 		 692 aa  53.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  27.48 
 
 		 646 aa  53.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  38.14 
 
 		 1225 aa  52.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  57.45 
 
 		 570 aa  51.6  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 462 aa  50.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.03 
 
 		 607 aa  50.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  39.19 
 
 		 1189 aa  50.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  43.94 
 
 		 518 aa  50.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  36.79 
 
 		 1532 aa  50.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  38.37 
 
 		 2503 aa  49.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  38.37 
 
 		 3699 aa  49.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.66 
 
 		 3089 aa  49.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  38.64 
 
 		 830 aa  48.9  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  38.33 
 
 		 724 aa  48.5  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  28.57 
 
 		 465 aa  47.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  35.48 
 
 		 1480 aa  48.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  34.15 
 
 		 1236 aa  48.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.21 
 
 		 3699 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  27.16 
 
 		 768 aa  47.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  27.95 
 
 		 756 aa  47.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  23.28 
 
 		 1814 aa  47.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  43.08 
 
 		 1184 aa  47  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  31.65 
 
 		 4428 aa  47  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  46.43 
 
 		 3822 aa  47  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  39.71 
 
 		 3907 aa  47  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  27.53 
 
 		 777 aa  46.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  29.29 
 
 		 1911 aa  46.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  48.94 
 
 		 3027 aa  46.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  37.5 
 
 		 1831 aa  46.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  46.81 
 
 		 4357 aa  45.8  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  36.05 
 
 		 2476 aa  45.8  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  27.95 
 
 		 764 aa  45.8  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  45.07 
 
 		 1107 aa  45.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  39.51 
 
 		 4009 aa  45.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  39.73 
 
 		 286 aa  45.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  48.15 
 
 		 3861 aa  45.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2024  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  45.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  31.48 
 
 		 2117 aa  45.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  38.37 
 
 		 3544 aa  45.1  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>