38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2647 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  100 
 
 		 1487 aa  3044    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1316 aa  514  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0462  hypothetical protein  28.96 
 
 		 618 aa  194  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271828  normal  0.328949 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  46.95 
 
 		 1908 aa  150  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  35.61 
 
 		 1188 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2650  hypothetical protein  33.23 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  32.45 
 
 		 1831 aa  121  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  37.73 
 
 		 692 aa  103  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  41.15 
 
 		 14609 aa  99  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3363  hypothetical protein  30.63 
 
 		 326 aa  91.7  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  36.94 
 
 		 1394 aa  90.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  50 
 
 		 767 aa  77.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  32.73 
 
 		 3027 aa  76.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  41.5 
 
 		 474 aa  67.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  37.75 
 
 		 1332 aa  65.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2649  hypothetical protein  73.81 
 
 		 71 aa  63.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.88539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  35.18 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  46.51 
 
 		 866 aa  58.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  37.96 
 
 		 3907 aa  58.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  35.35 
 
 		 1107 aa  56.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  39.67 
 
 		 654 aa  56.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  40 
 
 		 4009 aa  56.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  40 
 
 		 4022 aa  55.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  37.14 
 
 		 3861 aa  54.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 		 1100 aa  50.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  50.89 
 
 		 640 aa  50.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  35.19 
 
 		 286 aa  50.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.2 
 
 		 1407 aa  49.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  38.52 
 
 		 3822 aa  49.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  44.19 
 
 		 476 aa  48.5  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  38.64 
 
 		 1987 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  44.62 
 
 		 2117 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  58.54 
 
 		 830 aa  46.6  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0714  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1387 aa  47  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  26.13 
 
 		 4357 aa  45.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  45.16 
 
 		 682 aa  45.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  37.25 
 
 		 852 aa  45.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  23.58 
 
 		 932 aa  45.1  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>