16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0714 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0714  hypothetical protein  100 
 
 		 1387 aa  2826    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  64.45 
 
 		 1407 aa  1806    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0742  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.06 
 
 		 1355 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  36.65 
 
 		 1908 aa  75.1  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  37.35 
 
 		 2074 aa  67  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  35.14 
 
 		 1081 aa  55.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  42.55 
 
 		 1264 aa  53.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  45.16 
 
 		 1987 aa  53.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  34.48 
 
 		 14609 aa  51.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  33.12 
 
 		 8918 aa  50.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  44.58 
 
 		 1755 aa  50.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  39.29 
 
 		 3861 aa  49.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  36.04 
 
 		 3925 aa  48.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  32.52 
 
 		 692 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  30.41 
 
 		 1394 aa  46.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  45 
 
 		 561 aa  46.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>