71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3279 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  100 
 
 
4009 aa  8064    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  96.09 
 
 
4022 aa  7573    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  26.8 
 
 
4357 aa  246  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  33.49 
 
 
3861 aa  245  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.48 
 
 
3822 aa  242  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  31.49 
 
 
3907 aa  209  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  41.13 
 
 
2522 aa  77.4  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  41.94 
 
 
3544 aa  77.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  38 
 
 
14609 aa  75.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  39.13 
 
 
692 aa  71.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  41.13 
 
 
3699 aa  70.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.32 
 
 
3699 aa  70.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  40 
 
 
830 aa  68.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  35.56 
 
 
1831 aa  67  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  55.38 
 
 
1107 aa  65.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  43.69 
 
 
2476 aa  63.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  35.1 
 
 
1188 aa  61.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  38.02 
 
 
1394 aa  60.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  41.75 
 
 
2503 aa  58.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  35.04 
 
 
841 aa  58.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  37.14 
 
 
1316 aa  58.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  37.09 
 
 
462 aa  57.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  27.24 
 
 
2074 aa  57.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.89 
 
 
950 aa  56.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  32.05 
 
 
1487 aa  55.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.67 
 
 
994 aa  55.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  28.51 
 
 
3325 aa  55.5  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  34.68 
 
 
2636 aa  55.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  38.95 
 
 
3474 aa  54.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  40.59 
 
 
474 aa  54.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  41.49 
 
 
1908 aa  54.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.28 
 
 
761 aa  53.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  33.33 
 
 
5743 aa  53.5  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  28.57 
 
 
1589 aa  52.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  36.19 
 
 
3027 aa  53.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.88 
 
 
440 aa  52.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  29.7 
 
 
792 aa  52.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  28.95 
 
 
3824 aa  52.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  32.08 
 
 
1446 aa  52  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  45.07 
 
 
767 aa  52.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  29.41 
 
 
1224 aa  51.6  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  31.5 
 
 
1141 aa  51.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  29.32 
 
 
3824 aa  51.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.32 
 
 
3739 aa  51.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.32 
 
 
850 aa  50.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  34.88 
 
 
2701 aa  50.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1282  calcium-binding protein, putative  50 
 
 
63 aa  50.8  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.32 
 
 
3552 aa  50.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  32.74 
 
 
2135 aa  50.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  41.67 
 
 
2117 aa  49.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0462  hypothetical protein  32.17 
 
 
618 aa  49.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271828  normal  0.328949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  33.33 
 
 
2542 aa  50.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  32.81 
 
 
1269 aa  49.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  40.43 
 
 
866 aa  48.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  34.41 
 
 
2377 aa  48.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  35.33 
 
 
1269 aa  49.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  28.57 
 
 
3824 aa  48.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  37.63 
 
 
1744 aa  48.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  28.92 
 
 
675 aa  48.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3070  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  31.85 
 
 
315 aa  48.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.722808  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.39 
 
 
11716 aa  48.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  28.2 
 
 
3721 aa  48.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.29 
 
 
2507 aa  47.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  29.7 
 
 
892 aa  47.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  40.62 
 
 
1706 aa  47  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  29.61 
 
 
1752 aa  47  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  27.32 
 
 
1410 aa  46.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  35.51 
 
 
1987 aa  46.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  27.32 
 
 
1408 aa  47  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  27.32 
 
 
1410 aa  46.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  32.81 
 
 
1268 aa  46.6  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>