103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1756 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  44.29 
 
 		 1589 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  47.35 
 
 		 1785 aa  701    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  46.41 
 
 		 1838 aa  707    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  48.06 
 
 		 1728 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 2135 aa  4361    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  48.36 
 
 		 1051 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  47.31 
 
 		 2337 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  42.49 
 
 		 1627 aa  619  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  44.13 
 
 		 1752 aa  596  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  42.97 
 
 		 1781 aa  593  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  42.29 
 
 		 1744 aa  555  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  37.1 
 
 		 1282 aa  502  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  38.59 
 
 		 1389 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0452  hypothetical protein  30.17 
 
 		 673 aa  241  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  36.43 
 
 		 1005 aa  241  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0792  hypothetical protein  30.2 
 
 		 652 aa  237  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4223  hypothetical protein  29.58 
 
 		 673 aa  226  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  34.2 
 
 		 556 aa  200  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  30.65 
 
 		 509 aa  195  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  47.34 
 
 		 631 aa  164  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  34.54 
 
 		 824 aa  147  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  28.23 
 
 		 514 aa  142  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  28.4 
 
 		 522 aa  132  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  42.24 
 
 		 1009 aa  132  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  29.45 
 
 		 553 aa  131  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  29.49 
 
 		 552 aa  130  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  26.67 
 
 		 528 aa  122  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  27.63 
 
 		 542 aa  120  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  27.35 
 
 		 565 aa  120  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  28.28 
 
 		 506 aa  113  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  26.57 
 
 		 584 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  26.68 
 
 		 458 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  40.29 
 
 		 523 aa  107  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  25.75 
 
 		 569 aa  103  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  36.24 
 
 		 642 aa  102  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  34.93 
 
 		 430 aa  98.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  32.18 
 
 		 614 aa  98.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  39.32 
 
 		 119 aa  85.5  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3747  hypothetical protein  37.42 
 
 		 800 aa  84  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000112576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  27.27 
 
 		 559 aa  83.2  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1066 aa  79.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  25.67 
 
 		 448 aa  78.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  25.71 
 
 		 547 aa  77  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  36.81 
 
 		 685 aa  74.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  25.82 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  37.39 
 
 		 536 aa  72.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  27.48 
 
 		 628 aa  72  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  26.2 
 
 		 4761 aa  70.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.36 
 
 		 1686 aa  70.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  43.16 
 
 		 2117 aa  70.1  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  35.04 
 
 		 693 aa  67.4  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  38.68 
 
 		 595 aa  67  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  40.19 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  23.82 
 
 		 515 aa  65.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  34.07 
 
 		 651 aa  63.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.59 
 
 		 1627 aa  63.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  27.37 
 
 		 765 aa  62.8  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  37.76 
 
 		 1762 aa  61.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0023  putative YD repeat protein  35.63 
 
 		 683 aa  61.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  25.54 
 
 		 765 aa  61.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  37.84 
 
 		 767 aa  60.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.18 
 
 		 1726 aa  59.7  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.89 
 
 		 995 aa  59.3  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.27 
 
 		 1669 aa  58.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  32.74 
 
 		 656 aa  57.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.08 
 
 		 1590 aa  56.6  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  23.98 
 
 		 773 aa  55.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.28 
 
 		 546 aa  55.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  31.11 
 
 		 766 aa  54.3  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  25.79 
 
 		 772 aa  53.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  33.95 
 
 		 2178 aa  53.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  38.67 
 
 		 686 aa  52.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3586 aa  52  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2407  hypothetical protein  30 
 
 		 550 aa  52.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3307  hypothetical protein  34.06 
 
 		 612 aa  52  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  44.44 
 
 		 2030 aa  51.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  40.43 
 
 		 1748 aa  51.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.09 
 
 		 753 aa  51.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  33.33 
 
 		 4022 aa  51.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  30.43 
 
 		 635 aa  51.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  37.8 
 
 		 426 aa  50.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  30.77 
 
 		 978 aa  50.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1857  fibronectin type III domain-containing protein  38.67 
 
 		 733 aa  50.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  32.74 
 
 		 4009 aa  50.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.23 
 
 		 12684 aa  49.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  31.03 
 
 		 566 aa  49.7  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  22.55 
 
 		 717 aa  49.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1829  hypothetical protein  45.95 
 
 		 570 aa  48.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3090  fibronectin type III domain-containing protein  34 
 
 		 862 aa  48.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  28.57 
 
 		 3925 aa  48.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1026 aa  48.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0044  Fibronectin type III domain protein  41.67 
 
 		 743 aa  48.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0363  Fibronectin type III domain protein  34.78 
 
 		 278 aa  48.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00588673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1933 aa  48.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  32.2 
 
 		 4379 aa  47.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.84 
 
 		 587 aa  48.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2355  fibronectin, type III  38.89 
 
 		 128 aa  47.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  31.67 
 
 		 2796 aa  47  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  37.5 
 
 		 774 aa  47  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.17 
 
 		 587 aa  46.2  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>